22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2158 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2158  hypothetical protein  100 
 
 
1808 aa  3578    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  61.02 
 
 
1073 aa  175  5.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  46.75 
 
 
5080 aa  159  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.67 
 
 
1586 aa  142  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0007  putative lipoprotein  53.01 
 
 
981 aa  137  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.949934  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  44 
 
 
1787 aa  107  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  42.59 
 
 
657 aa  103  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0568  hypothetical protein  26.22 
 
 
1766 aa  87.4  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
16322 aa  67.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  28.93 
 
 
1538 aa  67  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.03 
 
 
1566 aa  65.9  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0010  hypothetical protein  37.63 
 
 
178 aa  54.7  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  38.79 
 
 
2542 aa  52.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  37.5 
 
 
4678 aa  52  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  28.31 
 
 
4214 aa  50.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  32.67 
 
 
1141 aa  49.3  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 
4791 aa  47.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  32.46 
 
 
5171 aa  47.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  27.63 
 
 
6662 aa  47.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.41 
 
 
6683 aa  46.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  30.84 
 
 
2524 aa  46.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  27.41 
 
 
6779 aa  45.8  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>