More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3258 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  34.7 
 
 		 4678 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.2 
 
 		 5839 aa  1095    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  100 
 
 		 4214 aa  7948    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  40.89 
 
 		 16322 aa  1074    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.61 
 
 		 4220 aa  983    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  37.45 
 
 		 5444 aa  931    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  44.64 
 
 		 5442 aa  1432    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  35.72 
 
 		 4791 aa  1227    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.88 
 
 		 4122 aa  474  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.05 
 
 		 2768 aa  382  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  33.99 
 
 		 6662 aa  263  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  33.98 
 
 		 6779 aa  262  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.14 
 
 		 6683 aa  261  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  29.45 
 
 		 4874 aa  245  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.66 
 
 		 4836 aa  241  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  29.65 
 
 		 4689 aa  236  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  41.42 
 
 		 2251 aa  233  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  31.33 
 
 		 1461 aa  216  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  33.16 
 
 		 7149 aa  209  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  58.29 
 
 		 2239 aa  199  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  30.1 
 
 		 5171 aa  195  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  51.56 
 
 		 4285 aa  191  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  56.54 
 
 		 2812 aa  191  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.51 
 
 		 5787 aa  168  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  29.12 
 
 		 3516 aa  138  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.33 
 
 		 3562 aa  135  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  45.77 
 
 		 8682 aa  122  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  45.77 
 
 		 9030 aa  122  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.83 
 
 		 5962 aa  121  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.89 
 
 		 1553 aa  120  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  45.39 
 
 		 6753 aa  119  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  49.57 
 
 		 5218 aa  118  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.94 
 
 		 2067 aa  117  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  35.52 
 
 		 4848 aa  115  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.55 
 
 		 3824 aa  114  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.6 
 
 		 3824 aa  114  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.53 
 
 		 3314 aa  108  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  39.88 
 
 		 3259 aa  101  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  41.24 
 
 		 1699 aa  101  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  44.44 
 
 		 2542 aa  100  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  43.42 
 
 		 1166 aa  99.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  35.17 
 
 		 8321 aa  96.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.86 
 
 		 2812 aa  96.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  42 
 
 		 3229 aa  96.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  45.58 
 
 		 542 aa  95.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  43.45 
 
 		 2524 aa  94.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  45.75 
 
 		 3182 aa  94  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  34.47 
 
 		 2887 aa  92.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  43.8 
 
 		 2452 aa  92  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  34.76 
 
 		 4854 aa  91.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  26.69 
 
 		 5080 aa  91.3  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  40.34 
 
 		 3758 aa  90.5  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  39.02 
 
 		 686 aa  89  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  45.33 
 
 		 3184 aa  88.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.86 
 
 		 1599 aa  88.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  35.12 
 
 		 1598 aa  87.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.08 
 
 		 3038 aa  85.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  44.26 
 
 		 2704 aa  85.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  32.94 
 
 		 7919 aa  84.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.49 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.15 
 
 		 5561 aa  82.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  33.33 
 
 		 7679 aa  81.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.12 
 
 		 4106 aa  80.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.19 
 
 		 1424 aa  80.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  55.68 
 
 		 606 aa  79.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  25.85 
 
 		 5559 aa  79.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3592  Hemolysin-type calcium-binding region  47.52 
 
 		 303 aa  79  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0868117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.5 
 
 		 1073 aa  78.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25.88 
 
 		 5559 aa  77.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  29.8 
 
 		 2042 aa  76.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  26.03 
 
 		 5561 aa  75.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.88 
 
 		 2678 aa  74.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  30.66 
 
 		 3333 aa  72.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  37.24 
 
 		 2743 aa  72  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  29.21 
 
 		 2345 aa  72.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  26.19 
 
 		 5561 aa  72.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  29.71 
 
 		 1529 aa  72.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.3 
 
 		 4013 aa  71.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  38.41 
 
 		 486 aa  71.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  39.07 
 
 		 2336 aa  71.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 		 1175 aa  71.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  40 
 
 		 1883 aa  70.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  50 
 
 		 4798 aa  70.5  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.89 
 
 		 1800 aa  70.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  28.54 
 
 		 2625 aa  70.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.89 
 
 		 8871 aa  70.1  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  46.32 
 
 		 202 aa  70.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  46.32 
 
 		 202 aa  70.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  47.31 
 
 		 260 aa  69.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  39.58 
 
 		 820 aa  68.6  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  52.11 
 
 		 1534 aa  68.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  34.65 
 
 		 2125 aa  69.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  45.74 
 
 		 507 aa  69.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  42.86 
 
 		 3598 aa  68.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.48 
 
 		 577 aa  68.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  47.47 
 
 		 1164 aa  68.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.89 
 
 		 3739 aa  67.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  47.13 
 
 		 5769 aa  68.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.89 
 
 		 2839 aa  67.4  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  43.17 
 
 		 4430 aa  67.4  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>