More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1854 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
5171 aa  9949    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.33 
 
 
6683 aa  513  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  39.41 
 
 
6779 aa  512  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  39.33 
 
 
6662 aa  511  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  48.39 
 
 
5442 aa  474  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  46.4 
 
 
4791 aa  468  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.74 
 
 
5839 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  41.14 
 
 
2768 aa  297  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  40.33 
 
 
7149 aa  276  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  27.51 
 
 
5561 aa  240  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.59 
 
 
5561 aa  236  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.5 
 
 
5561 aa  235  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  30.33 
 
 
4214 aa  221  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  27.28 
 
 
1461 aa  181  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  28.36 
 
 
5559 aa  179  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  27.2 
 
 
5559 aa  179  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  39.29 
 
 
606 aa  170  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  49.12 
 
 
1164 aa  167  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  37.36 
 
 
2542 aa  166  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.3 
 
 
3427 aa  163  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 
1795 aa  160  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.38 
 
 
980 aa  158  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  49.76 
 
 
946 aa  157  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  43.61 
 
 
2145 aa  155  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  48.06 
 
 
2105 aa  155  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  41.09 
 
 
561 aa  155  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  50.79 
 
 
1279 aa  154  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  46.23 
 
 
1424 aa  154  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.23 
 
 
588 aa  153  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  45.16 
 
 
1287 aa  152  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45.15 
 
 
2954 aa  152  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  31.97 
 
 
2127 aa  152  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  50.87 
 
 
3954 aa  149  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  44.13 
 
 
982 aa  149  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  45.64 
 
 
1534 aa  148  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 
1895 aa  146  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.86 
 
 
2239 aa  145  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  49.72 
 
 
813 aa  143  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  37.44 
 
 
5444 aa  142  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  48.77 
 
 
4334 aa  142  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  41.77 
 
 
589 aa  142  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.03 
 
 
1963 aa  140  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  31.56 
 
 
16322 aa  140  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.85 
 
 
3721 aa  140  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.26 
 
 
460 aa  138  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.98 
 
 
2668 aa  139  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.4 
 
 
3824 aa  137  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  42.59 
 
 
615 aa  137  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  37.35 
 
 
526 aa  137  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.46 
 
 
2667 aa  136  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  29.85 
 
 
4689 aa  136  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.88 
 
 
3619 aa  135  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.62 
 
 
3739 aa  135  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  42.37 
 
 
833 aa  135  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  45.02 
 
 
260 aa  135  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  46.35 
 
 
3619 aa  134  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  44.49 
 
 
2251 aa  135  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.51 
 
 
2812 aa  134  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.06 
 
 
2678 aa  133  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.21 
 
 
3824 aa  132  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.05 
 
 
5098 aa  131  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  38.52 
 
 
387 aa  131  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 
363 aa  130  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
9867 aa  130  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  42.99 
 
 
850 aa  129  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  48.54 
 
 
243 aa  129  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.17 
 
 
3209 aa  128  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42.55 
 
 
1532 aa  129  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.56 
 
 
1236 aa  129  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  44.5 
 
 
491 aa  129  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.17 
 
 
2689 aa  127  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.25 
 
 
3824 aa  127  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  38.66 
 
 
460 aa  127  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 
1383 aa  125  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  46.7 
 
 
341 aa  125  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  39.35 
 
 
1079 aa  124  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  38.79 
 
 
724 aa  124  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  34.65 
 
 
424 aa  124  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.24 
 
 
421 aa  124  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  45.12 
 
 
734 aa  123  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  40.37 
 
 
709 aa  123  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  39.11 
 
 
1883 aa  123  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  38.73 
 
 
1855 aa  123  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  40.89 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  40.1 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  48.3 
 
 
686 aa  122  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.79 
 
 
1016 aa  121  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  47.85 
 
 
202 aa  120  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  45.83 
 
 
219 aa  120  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  47.85 
 
 
202 aa  120  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  38.66 
 
 
595 aa  120  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.7 
 
 
1197 aa  120  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  41.39 
 
 
1712 aa  120  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  45.56 
 
 
950 aa  120  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 
341 aa  120  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  38.18 
 
 
795 aa  119  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  38.53 
 
 
385 aa  119  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.76 
 
 
4687 aa  119  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  44.19 
 
 
741 aa  119  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  44.19 
 
 
938 aa  119  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>