More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3808 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  54.42 
 
 		 2887 aa  1926    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2524 aa  4955    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1806 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  27.91 
 
 		 3182 aa  336  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28.73 
 
 		 3714 aa  222  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  34.72 
 
 		 16311 aa  211  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.17 
 
 		 3508 aa  197  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  27.24 
 
 		 3229 aa  195  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  24.35 
 
 		 4661 aa  185  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.96 
 
 		 1553 aa  177  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.75 
 
 		 1599 aa  164  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.38 
 
 		 5745 aa  162  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  28.08 
 
 		 3259 aa  158  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.38 
 
 		 4978 aa  152  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  26.25 
 
 		 6211 aa  152  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.7 
 
 		 4122 aa  150  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1350 aa  150  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.6 
 
 		 4220 aa  145  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  27.89 
 
 		 16322 aa  135  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  26.62 
 
 		 3439 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.14 
 
 		 3038 aa  134  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.66 
 
 		 4836 aa  128  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  24.53 
 
 		 3927 aa  126  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  31.37 
 
 		 4748 aa  124  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  45.24 
 
 		 5218 aa  123  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  48.59 
 
 		 8682 aa  120  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  48.59 
 
 		 9030 aa  120  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  47.43 
 
 		 6753 aa  120  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  26.43 
 
 		 5123 aa  116  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.05 
 
 		 2067 aa  115  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.75 
 
 		 5962 aa  114  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  27.48 
 
 		 4285 aa  113  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  41.25 
 
 		 2542 aa  108  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 5787 aa  103  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.45 
 
 		 3191 aa  103  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.07 
 
 		 2239 aa  102  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.14 
 
 		 6683 aa  102  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  43.62 
 
 		 6779 aa  102  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  44.14 
 
 		 6662 aa  102  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.71 
 
 		 5839 aa  102  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  32.43 
 
 		 2768 aa  100  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  25.16 
 
 		 2784 aa  100  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.76 
 
 		 2812 aa  99.4  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.84 
 
 		 1884 aa  97.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.41 
 
 		 5098 aa  96.7  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  43.45 
 
 		 4214 aa  94.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  26.91 
 
 		 3263 aa  94  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.88 
 
 		 1706 aa  93.6  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  34.22 
 
 		 4678 aa  93.2  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  25.33 
 
 		 1268 aa  92.8  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  25 
 
 		 1269 aa  92  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  26.27 
 
 		 1269 aa  92.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  32.78 
 
 		 2251 aa  92  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  26.88 
 
 		 4854 aa  90.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  42.86 
 
 		 5442 aa  85.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  45.9 
 
 		 1610 aa  83.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  54.44 
 
 		 2911 aa  83.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 3184 aa  82.4  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  27.94 
 
 		 5094 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  38.15 
 
 		 542 aa  80.1  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  48.28 
 
 		 8321 aa  80.1  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  53.01 
 
 		 1610 aa  79.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  43.75 
 
 		 1883 aa  79.7  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1699 aa  79.3  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  41.26 
 
 		 1166 aa  79.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  42.86 
 
 		 476 aa  78.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  44.26 
 
 		 474 aa  77.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  51.81 
 
 		 481 aa  77  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  25.5 
 
 		 7233 aa  75.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  43.85 
 
 		 1037 aa  75.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  37.7 
 
 		 2704 aa  73.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  39.86 
 
 		 504 aa  73.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  25.69 
 
 		 1597 aa  73.2  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.46 
 
 		 761 aa  73.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  43.1 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  50 
 
 		 476 aa  72.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  36.62 
 
 		 2743 aa  72.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  50 
 
 		 475 aa  71.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  26.57 
 
 		 2816 aa  71.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  54.88 
 
 		 1884 aa  70.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  41.32 
 
 		 479 aa  71.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  42.15 
 
 		 479 aa  70.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.65 
 
 		 4106 aa  70.1  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  41.94 
 
 		 686 aa  70.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  56.34 
 
 		 2950 aa  69.7  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  51.32 
 
 		 907 aa  69.3  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  43.16 
 
 		 1557 aa  69.3  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  42.28 
 
 		 759 aa  68.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.52 
 
 		 1145 aa  69.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 		 3396 aa  67.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  41.55 
 
 		 7149 aa  68.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  45.88 
 
 		 513 aa  68.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  49.4 
 
 		 480 aa  68.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  34.15 
 
 		 4791 aa  68.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.82 
 
 		 994 aa  67.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 		 1073 aa  66.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  34.38 
 
 		 7919 aa  66.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  41.13 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  41.67 
 
 		 2890 aa  66.2  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.66 
 
 		 2678 aa  66.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>