More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1897 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  100 
 
 		 1557 aa  3126    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  35.47 
 
 		 1838 aa  500  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.99 
 
 		 2807 aa  350  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  36.68 
 
 		 1289 aa  290  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  36.58 
 
 		 2024 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  34.64 
 
 		 4379 aa  263  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  39.28 
 
 		 1013 aa  259  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  43.46 
 
 		 1025 aa  249  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1933 aa  221  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.54 
 
 		 1340 aa  209  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.3 
 
 		 1118 aa  209  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.95 
 
 		 1019 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.76 
 
 		 2194 aa  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.42 
 
 		 1113 aa  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.36 
 
 		 1225 aa  202  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.36 
 
 		 1222 aa  201  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.16 
 
 		 889 aa  200  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.9 
 
 		 1009 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.65 
 
 		 1012 aa  176  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  34.07 
 
 		 828 aa  166  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  34.57 
 
 		 3954 aa  155  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  32.95 
 
 		 554 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  36.58 
 
 		 1490 aa  152  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  33.62 
 
 		 386 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.92 
 
 		 872 aa  149  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  31.99 
 
 		 412 aa  146  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.13 
 
 		 891 aa  143  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  30.5 
 
 		 644 aa  138  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  42.98 
 
 		 1144 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  44.9 
 
 		 2097 aa  130  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.32 
 
 		 1122 aa  130  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  43.78 
 
 		 2911 aa  124  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4265  Nidogen, extracellular region  35.32 
 
 		 474 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.205144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.48 
 
 		 1126 aa  121  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  51.08 
 
 		 1126 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.12 
 
 		 1415 aa  118  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  40.19 
 
 		 2954 aa  113  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  39.39 
 
 		 2198 aa  113  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  39.9 
 
 		 1610 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  39.8 
 
 		 1764 aa  110  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  30.66 
 
 		 604 aa  109  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  36.97 
 
 		 2133 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  30.87 
 
 		 974 aa  106  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.56 
 
 		 1275 aa  105  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  34.98 
 
 		 662 aa  105  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  33.76 
 
 		 854 aa  104  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  36.29 
 
 		 1072 aa  103  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  29.7 
 
 		 813 aa  104  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.69 
 
 		 1079 aa  103  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  39.15 
 
 		 462 aa  102  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  36.4 
 
 		 2467 aa  103  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.25 
 
 		 616 aa  102  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 467 aa  102  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  40.5 
 
 		 1145 aa  102  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  38.6 
 
 		 503 aa  100  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  35.89 
 
 		 475 aa  99.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 		 1884 aa  100  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  40.19 
 
 		 1134 aa  100  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  37.67 
 
 		 503 aa  99.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 		 907 aa  99.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.68 
 
 		 3197 aa  99.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.39 
 
 		 4334 aa  99  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  30.14 
 
 		 472 aa  97.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  34.86 
 
 		 475 aa  97.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  38.27 
 
 		 6678 aa  95.9  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  29.35 
 
 		 2461 aa  94.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.48 
 
 		 648 aa  93.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.92 
 
 		 1029 aa  93.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  35.82 
 
 		 3209 aa  93.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  32.92 
 
 		 1029 aa  93.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  31.37 
 
 		 820 aa  93.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 		 1855 aa  92  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  37.82 
 
 		 1610 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1424 aa  91.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.77 
 
 		 2678 aa  91.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.33 
 
 		 1390 aa  91.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.94 
 
 		 3197 aa  90.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  33.49 
 
 		 1112 aa  89.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  30.16 
 
 		 3608 aa  89  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.93 
 
 		 2775 aa  89  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  32.78 
 
 		 1197 aa  88.6  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  33.93 
 
 		 768 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  29.51 
 
 		 4661 aa  87.8  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.74 
 
 		 946 aa  87.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  33.48 
 
 		 745 aa  87.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  37.91 
 
 		 395 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  30.48 
 
 		 928 aa  87.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  37.91 
 
 		 395 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.02 
 
 		 824 aa  87  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  33.06 
 
 		 851 aa  86.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  37.06 
 
 		 727 aa  85.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  30.28 
 
 		 663 aa  84.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.34 
 
 		 2667 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  41.09 
 
 		 1534 aa  85.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  33.46 
 
 		 1133 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.39 
 
 		 556 aa  83.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  30.42 
 
 		 2950 aa  82.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  34.13 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28 
 
 		 3026 aa  82  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.74 
 
 		 2701 aa  82  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>