123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2273 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  100 
 
 		 472 aa  959    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  60.34 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  38.94 
 
 		 494 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  37.2 
 
 		 485 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.39 
 
 		 1225 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.48 
 
 		 1340 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.47 
 
 		 889 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.52 
 
 		 1113 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.12 
 
 		 1222 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  39.48 
 
 		 974 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.03 
 
 		 1275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.13 
 
 		 1118 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.81 
 
 		 1019 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.43 
 
 		 2194 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  28.81 
 
 		 872 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.35 
 
 		 2807 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.14 
 
 		 1557 aa  98.2  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29.72 
 
 		 1490 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.14 
 
 		 1838 aa  97.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  32.44 
 
 		 412 aa  97.1  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  33.8 
 
 		 1126 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.27 
 
 		 891 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 1009 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  36.82 
 
 		 828 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  34.78 
 
 		 604 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  33.48 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  28.97 
 
 		 813 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.94 
 
 		 1012 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1289 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.53 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  34.15 
 
 		 3197 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  32.35 
 
 		 1124 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  29.73 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  31.55 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  23.1 
 
 		 4379 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.65 
 
 		 3197 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  26.27 
 
 		 685 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  28.28 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  28.63 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  27.8 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  30.89 
 
 		 1109 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  24.8 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  26.95 
 
 		 917 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  26.52 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  27.42 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.08 
 
 		 1193 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  32.07 
 
 		 803 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.86 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  26.45 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 1127 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  25.41 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  27 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  31.28 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.11 
 
 		 556 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  30.11 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.16 
 
 		 1236 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.82 
 
 		 737 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.69 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  27.24 
 
 		 577 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  28.17 
 
 		 1098 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.78 
 
 		 11716 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  26.29 
 
 		 1022 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  27.85 
 
 		 720 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  26.98 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.02 
 
 		 1208 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  29.12 
 
 		 1126 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  27.6 
 
 		 1505 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  31.65 
 
 		 1120 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.2 
 
 		 1226 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  28.65 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 		 837 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  25.23 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.7 
 
 		 1113 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.87 
 
 		 1189 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  28.57 
 
 		 644 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  28.26 
 
 		 521 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.26 
 
 		 585 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1575 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  27.18 
 
 		 1446 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  40 
 
 		 1208 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.66 
 
 		 1114 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.99 
 
 		 959 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.08 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  30.43 
 
 		 1127 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  26.96 
 
 		 590 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.76 
 
 		 1228 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  26.87 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  30.06 
 
 		 574 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  29.79 
 
 		 522 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  28.15 
 
 		 566 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3884  YD repeat protein  32.79 
 
 		 1879 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1328 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.91 
 
 		 1098 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  25.31 
 
 		 2698 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.83 
 
 		 638 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.36 
 
 		 655 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.02 
 
 		 593 aa  46.6  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  27.47 
 
 		 681 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  26.7 
 
 		 2558 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>