119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1026 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  100 
 
 		 4379 aa  8809    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  58.65 
 
 		 1933 aa  384  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  43.8 
 
 		 2807 aa  376  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.48 
 
 		 1838 aa  313  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  34.44 
 
 		 1557 aa  262  9e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  41.76 
 
 		 1013 aa  246  7.999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1289 aa  238  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  37.12 
 
 		 1025 aa  202  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  37.66 
 
 		 2024 aa  199  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.54 
 
 		 889 aa  174  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29.46 
 
 		 1019 aa  173  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.75 
 
 		 2194 aa  164  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.74 
 
 		 1118 aa  161  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.19 
 
 		 1113 aa  159  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  33.92 
 
 		 554 aa  153  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.56 
 
 		 1340 aa  152  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.42 
 
 		 1009 aa  150  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.28 
 
 		 1222 aa  147  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  40.1 
 
 		 6678 aa  145  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.76 
 
 		 1225 aa  140  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32 
 
 		 872 aa  137  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  27.54 
 
 		 828 aa  136  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.18 
 
 		 1012 aa  131  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.32 
 
 		 891 aa  128  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  31.44 
 
 		 412 aa  128  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  55.75 
 
 		 2852 aa  123  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  30.99 
 
 		 386 aa  118  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  34.18 
 
 		 1126 aa  116  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  53.15 
 
 		 3977 aa  116  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  46.94 
 
 		 1126 aa  115  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  26.64 
 
 		 2461 aa  114  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  49.17 
 
 		 1587 aa  111  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  28.07 
 
 		 644 aa  110  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29.69 
 
 		 1490 aa  110  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  29.46 
 
 		 662 aa  109  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  46.9 
 
 		 692 aa  108  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  28 
 
 		 813 aa  105  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  30.91 
 
 		 4661 aa  102  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.8 
 
 		 1275 aa  89  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31 
 
 		 974 aa  83.2  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.97 
 
 		 604 aa  81.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.02 
 
 		 1372 aa  80.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  45.78 
 
 		 2003 aa  79.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.84 
 
 		 616 aa  77.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  39.83 
 
 		 16311 aa  76.6  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  30.94 
 
 		 494 aa  74.3  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  36.23 
 
 		 3834 aa  72.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.79 
 
 		 1124 aa  70.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  38.94 
 
 		 2796 aa  70.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  23.1 
 
 		 472 aa  70.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.23 
 
 		 8871 aa  68.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  28.88 
 
 		 657 aa  67.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  38.71 
 
 		 536 aa  67  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1127 aa  66.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4130  C-type lectin domain protein  34.29 
 
 		 186 aa  66.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.97 
 
 		 3197 aa  65.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4091  C-type lectin domain protein  34.71 
 
 		 186 aa  65.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  31.8 
 
 		 469 aa  64.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  24.63 
 
 		 917 aa  63.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  30.11 
 
 		 803 aa  62.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  30.71 
 
 		 767 aa  62.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.91 
 
 		 3089 aa  62  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  26.37 
 
 		 663 aa  61.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  35.83 
 
 		 693 aa  62  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  27.31 
 
 		 485 aa  60.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  26.12 
 
 		 438 aa  60.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  34.51 
 
 		 685 aa  60.1  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  35.59 
 
 		 4697 aa  59.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  30.11 
 
 		 524 aa  60.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 2345 aa  59.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.47 
 
 		 1052 aa  58.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.65 
 
 		 1284 aa  58.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.69 
 
 		 737 aa  58.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.1 
 
 		 593 aa  57  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  26.15 
 
 		 447 aa  56.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  28.74 
 
 		 837 aa  56.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.91 
 
 		 569 aa  56.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1575 aa  55.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.96 
 
 		 2002 aa  55.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  25.94 
 
 		 435 aa  55.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  30.4 
 
 		 3320 aa  55.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.25 
 
 		 3197 aa  55.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  33.33 
 
 		 2182 aa  55.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  23.79 
 
 		 456 aa  55.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  30.35 
 
 		 1113 aa  54.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1210 aa  54.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.63 
 
 		 11716 aa  53.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  25.66 
 
 		 751 aa  53.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  28.76 
 
 		 437 aa  53.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30.48 
 
 		 685 aa  52.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.23 
 
 		 600 aa  52.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  30.91 
 
 		 5769 aa  51.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  31.31 
 
 		 595 aa  51.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 404 aa  51.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.64 
 
 		 995 aa  51.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.7 
 
 		 3619 aa  50.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  21.77 
 
 		 517 aa  50.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.7 
 
 		 3619 aa  50.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.33 
 
 		 1236 aa  50.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.05 
 
 		 1189 aa  50.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>