123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1928 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 872 aa  1721    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  33.94 
 
 		 554 aa  237  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  40.06 
 
 		 1019 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  31.66 
 
 		 1126 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.1 
 
 		 1118 aa  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  36.01 
 
 		 1838 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.31 
 
 		 1340 aa  198  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.82 
 
 		 889 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.51 
 
 		 1222 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.24 
 
 		 1113 aa  187  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.12 
 
 		 2194 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  30.53 
 
 		 828 aa  180  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.71 
 
 		 1225 aa  171  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.06 
 
 		 891 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.57 
 
 		 1009 aa  164  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  35.96 
 
 		 2807 aa  161  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  32.92 
 
 		 412 aa  159  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32 
 
 		 1012 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  32.36 
 
 		 1557 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  31.83 
 
 		 813 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  28.22 
 
 		 4379 aa  139  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  32.88 
 
 		 386 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  34.17 
 
 		 1275 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  49.62 
 
 		 659 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  31.53 
 
 		 644 aa  126  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  33.33 
 
 		 1490 aa  124  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.44 
 
 		 616 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  31.3 
 
 		 604 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.65 
 
 		 472 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  25.03 
 
 		 1124 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.86 
 
 		 684 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  33.71 
 
 		 662 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  32 
 
 		 974 aa  98.6  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 537 aa  94.7  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.06 
 
 		 3197 aa  93.2  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  32.31 
 
 		 494 aa  91.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2251  hypothetical protein  36.96 
 
 		 887 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00410803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.62 
 
 		 469 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0646  hypothetical protein  32.33 
 
 		 521 aa  87.8  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  28.5 
 
 		 485 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30.16 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  30.52 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  23.05 
 
 		 917 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  28.68 
 
 		 685 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  27.36 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.39 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.16 
 
 		 676 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.65 
 
 		 3197 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  27.04 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  23.96 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  27.13 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  37.21 
 
 		 1022 aa  67  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  24.64 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.73 
 
 		 959 aa  65.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1127 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1328 aa  64.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  31.4 
 
 		 837 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1575 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.93 
 
 		 11716 aa  63.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.76 
 
 		 596 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  33.5 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.86 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  38 
 
 		 110 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  23.22 
 
 		 829 aa  58.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  22.8 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.59 
 
 		 737 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  25.88 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.63 
 
 		 556 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.13 
 
 		 1109 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  25 
 
 		 517 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.76 
 
 		 655 aa  56.2  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.12 
 
 		 1226 aa  55.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  31.09 
 
 		 1527 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  29.41 
 
 		 437 aa  55.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  24.29 
 
 		 593 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  24.92 
 
 		 593 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  28.38 
 
 		 1098 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.35 
 
 		 604 aa  54.3  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  33.59 
 
 		 649 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  37.04 
 
 		 161 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  25.7 
 
 		 435 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 		 635 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  25.08 
 
 		 417 aa  52.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.97 
 
 		 569 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.07 
 
 		 1246 aa  52  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.24 
 
 		 546 aa  52  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.23 
 
 		 794 aa  52  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  26.45 
 
 		 577 aa  51.2  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1638 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  24.35 
 
 		 2513 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  27.41 
 
 		 1126 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.09 
 
 		 1170 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.02 
 
 		 1129 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  26.45 
 
 		 590 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  25.24 
 
 		 491 aa  48.9  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.96 
 
 		 1114 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.29 
 
 		 1189 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.42 
 
 		 1127 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>