87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0931 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1014    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  33.53 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  31.73 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.38 
 
 		 803 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.72 
 
 		 562 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.83 
 
 		 556 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.23 
 
 		 1170 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  30.63 
 
 		 569 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.49 
 
 		 600 aa  97.4  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.12 
 
 		 1208 aa  97.1  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1127 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1575 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  27.9 
 
 		 593 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.3 
 
 		 1098 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.11 
 
 		 596 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.41 
 
 		 649 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  29.31 
 
 		 685 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  29.31 
 
 		 685 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.73 
 
 		 1236 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.07 
 
 		 1226 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.27 
 
 		 1193 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.83 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  27.32 
 
 		 1109 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.24 
 
 		 1192 aa  83.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.3 
 
 		 1189 aa  83.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  27.32 
 
 		 1183 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  28.74 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.23 
 
 		 1228 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.62 
 
 		 1120 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.68 
 
 		 604 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.58 
 
 		 1114 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.76 
 
 		 737 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.84 
 
 		 1225 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.17 
 
 		 1246 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  24.3 
 
 		 1088 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  29.35 
 
 		 1203 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  28.32 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  25.51 
 
 		 681 aa  77  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.38 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  27.41 
 
 		 573 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.8 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.27 
 
 		 1113 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.27 
 
 		 585 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  28.21 
 
 		 691 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1184 aa  70.5  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.8 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  29.43 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  25.83 
 
 		 1098 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.25 
 
 		 1126 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.65 
 
 		 1129 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  25.66 
 
 		 1161 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  24.93 
 
 		 872 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.62 
 
 		 951 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  30.54 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  25.86 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.46 
 
 		 1127 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.78 
 
 		 1019 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.68 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.04 
 
 		 8871 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.69 
 
 		 3197 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.16 
 
 		 1166 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.87 
 
 		 616 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  27.72 
 
 		 646 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.53 
 
 		 1838 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.66 
 
 		 3197 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  33.87 
 
 		 664 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  40.62 
 
 		 1133 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.42 
 
 		 554 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  31.76 
 
 		 878 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.17 
 
 		 1040 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  31.25 
 
 		 1208 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.62 
 
 		 1126 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  24.88 
 
 		 758 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.1 
 
 		 1066 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.98 
 
 		 1557 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  23.42 
 
 		 604 aa  47  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  28.07 
 
 		 1107 aa  47  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 		 1138 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  36.92 
 
 		 1124 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.11 
 
 		 2807 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  25.74 
 
 		 752 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  24.64 
 
 		 768 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  22.56 
 
 		 566 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  23.12 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.52 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  29.41 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  22.35 
 
 		 437 aa  43.9  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>