120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2319 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.92 
 
 		 1225 aa  1404    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  63.26 
 
 		 1236 aa  1444    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  56.27 
 
 		 1193 aa  1209    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  60.37 
 
 		 1208 aa  1335    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.44 
 
 		 1228 aa  1392    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.14 
 
 		 1246 aa  1413    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 1192 aa  2385    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  45.01 
 
 		 1114 aa  853    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  60.78 
 
 		 1170 aa  1340    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  60.58 
 
 		 1226 aa  1375    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  50.04 
 
 		 1189 aa  978    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  34.43 
 
 		 1183 aa  599  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  33 
 
 		 1203 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  34.61 
 
 		 1208 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  38.08 
 
 		 1120 aa  529  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  33.67 
 
 		 1127 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  33.89 
 
 		 1113 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  33.77 
 
 		 1129 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  36.5 
 
 		 1098 aa  485  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  32.97 
 
 		 1109 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  32.99 
 
 		 1172 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  31.89 
 
 		 1166 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  30.7 
 
 		 1088 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  32.52 
 
 		 1098 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  31.62 
 
 		 1161 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  30.14 
 
 		 1126 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  30.86 
 
 		 1107 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  35.06 
 
 		 593 aa  226  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  31.62 
 
 		 604 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  29.72 
 
 		 593 aa  205  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.45 
 
 		 551 aa  201  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  32.34 
 
 		 649 aa  197  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  31.27 
 
 		 583 aa  181  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.78 
 
 		 1066 aa  180  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.79 
 
 		 600 aa  175  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  31.58 
 
 		 604 aa  174  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.06 
 
 		 596 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.93 
 
 		 546 aa  166  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  28.06 
 
 		 556 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  30.65 
 
 		 562 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  31.87 
 
 		 577 aa  162  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  29.82 
 
 		 569 aa  161  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.25 
 
 		 574 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.62 
 
 		 737 aa  156  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  29.04 
 
 		 573 aa  154  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  30.72 
 
 		 566 aa  143  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.98 
 
 		 574 aa  140  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.77 
 
 		 803 aa  128  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.97 
 
 		 585 aa  122  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.35 
 
 		 585 aa  122  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.11 
 
 		 573 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1575 aa  116  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.75 
 
 		 1040 aa  115  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1127 aa  111  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  29.15 
 
 		 554 aa  108  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.26 
 
 		 951 aa  104  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.26 
 
 		 657 aa  100  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  26.03 
 
 		 655 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.87 
 
 		 668 aa  95.1  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  28.07 
 
 		 499 aa  93.2  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.68 
 
 		 691 aa  89  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.58 
 
 		 655 aa  88.2  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  25.62 
 
 		 658 aa  84.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  27.53 
 
 		 655 aa  83.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  24.71 
 
 		 521 aa  80.1  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.09 
 
 		 638 aa  80.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.2 
 
 		 526 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.52 
 
 		 1838 aa  75.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.68 
 
 		 1019 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.89 
 
 		 453 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.37 
 
 		 1126 aa  69.3  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.27 
 
 		 1113 aa  68.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 1184 aa  68.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  23.68 
 
 		 646 aa  67.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  31.28 
 
 		 878 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  23.78 
 
 		 667 aa  66.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.78 
 
 		 677 aa  65.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.73 
 
 		 1275 aa  65.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29.1 
 
 		 1490 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.12 
 
 		 2194 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.05 
 
 		 1138 aa  64.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.86 
 
 		 1118 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  32.81 
 
 		 482 aa  62  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  27 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  22.53 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.25 
 
 		 889 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.22 
 
 		 645 aa  61.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30 
 
 		 3197 aa  59.7  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  35.25 
 
 		 8871 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.04 
 
 		 1225 aa  59.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.23 
 
 		 2807 aa  58.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.69 
 
 		 1222 aa  58.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  31.43 
 
 		 566 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.59 
 
 		 730 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  28.74 
 
 		 616 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.84 
 
 		 1340 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  26.09 
 
 		 1124 aa  55.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  30.24 
 
 		 3197 aa  55.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  28.57 
 
 		 645 aa  55.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>