47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0911 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  100 
 
 		 664 aa  1377    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  37.44 
 
 		 646 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  27.06 
 
 		 752 aa  187  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  26.71 
 
 		 645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  24.55 
 
 		 878 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.6 
 
 		 600 aa  72  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.56 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.48 
 
 		 1129 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  32 
 
 		 604 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 1127 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.63 
 
 		 1208 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.65 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  27.36 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.74 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.22 
 
 		 1040 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.23 
 
 		 596 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  29.7 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  29.79 
 
 		 574 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.98 
 
 		 574 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  29.47 
 
 		 566 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  33.87 
 
 		 499 aa  54.3  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.11 
 
 		 737 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  21.03 
 
 		 1088 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  27.43 
 
 		 1183 aa  51.2  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  28.19 
 
 		 510 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  23.58 
 
 		 1208 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.06 
 
 		 1189 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.67 
 
 		 546 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.01 
 
 		 1192 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  23.36 
 
 		 569 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.87 
 
 		 585 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  32.08 
 
 		 1126 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  23.25 
 
 		 562 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  29.71 
 
 		 573 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  32.67 
 
 		 803 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.59 
 
 		 1127 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  24.06 
 
 		 1275 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  28 
 
 		 1161 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  25.68 
 
 		 506 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.32 
 
 		 2807 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  26.64 
 
 		 3197 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.63 
 
 		 649 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.08 
 
 		 1066 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.29 
 
 		 1490 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.39 
 
 		 1228 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.36 
 
 		 1226 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.82 
 
 		 585 aa  43.9  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>