91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2331 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 
585 aa  1168    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  34.07 
 
 
573 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  33.95 
 
 
562 aa  236  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  34.8 
 
 
577 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  30.22 
 
 
556 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  33.46 
 
 
593 aa  210  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.22 
 
 
596 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  30.24 
 
 
649 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  32.68 
 
 
574 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.66 
 
 
551 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  28.34 
 
 
593 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  30.21 
 
 
604 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.37 
 
 
546 aa  177  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  29.42 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  29.43 
 
 
569 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.38 
 
 
600 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.22 
 
 
574 aa  160  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  30.46 
 
 
604 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
1127 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.62 
 
 
1170 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.1 
 
 
1246 aa  104  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.03 
 
 
1192 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.05 
 
 
803 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.83 
 
 
1236 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.3 
 
 
737 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.76 
 
 
1225 aa  98.2  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.77 
 
 
1208 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.8 
 
 
1226 aa  94  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.11 
 
 
1228 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.43 
 
 
585 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.19 
 
 
1193 aa  87  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.05 
 
 
554 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.82 
 
 
1114 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.56 
 
 
1189 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  24.62 
 
 
1575 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  21.91 
 
 
1088 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.17 
 
 
1126 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
1184 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  23.05 
 
 
1129 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.23 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  26.55 
 
 
1098 aa  70.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  31.13 
 
 
1120 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  42.86 
 
 
1107 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  35.8 
 
 
499 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23.07 
 
 
1183 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  31.39 
 
 
1113 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.91 
 
 
1066 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  34.45 
 
 
1127 aa  67  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.44 
 
 
951 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.61 
 
 
1098 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  38.75 
 
 
1172 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  27.22 
 
 
878 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.68 
 
 
492 aa  63.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  30.87 
 
 
1208 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  42.67 
 
 
1161 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  22.44 
 
 
1166 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  24.43 
 
 
1109 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  32.61 
 
 
685 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.16 
 
 
455 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  32.61 
 
 
685 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26.18 
 
 
691 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  35.53 
 
 
566 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  33.09 
 
 
1275 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  29.17 
 
 
646 aa  55.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  27.23 
 
 
482 aa  55.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  25.36 
 
 
645 aa  54.7  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  35.29 
 
 
590 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  27.27 
 
 
1203 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  28.79 
 
 
616 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  31.43 
 
 
566 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  29.45 
 
 
1133 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  30.94 
 
 
655 aa  51.6  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.36 
 
 
2807 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  25 
 
 
655 aa  50.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  34.26 
 
 
472 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  33.1 
 
 
469 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.36 
 
 
1040 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  29.87 
 
 
664 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  24.81 
 
 
1019 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  28.66 
 
 
620 aa  47.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.32 
 
 
11716 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.28 
 
 
3197 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.74 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29.24 
 
 
1490 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  28.89 
 
 
681 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.06 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  37.66 
 
 
752 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.33 
 
 
3197 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  35.09 
 
 
685 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.16 
 
 
1012 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>