112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1795 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  60.68 
 
 		 1225 aa  1346    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  60.33 
 
 		 1236 aa  1370    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  53.07 
 
 		 1193 aa  1107    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  58.14 
 
 		 1208 aa  1302    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 1228 aa  2473    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  80 
 
 		 1246 aa  1884    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.44 
 
 		 1192 aa  1367    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.35 
 
 		 1114 aa  882    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.89 
 
 		 1170 aa  1384    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  58.12 
 
 		 1226 aa  1325    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  47 
 
 		 1189 aa  899    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  34.76 
 
 		 1183 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  33.03 
 
 		 1203 aa  569  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  34.72 
 
 		 1208 aa  556  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  34.36 
 
 		 1113 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  33.78 
 
 		 1109 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  32.98 
 
 		 1127 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  32.28 
 
 		 1129 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  35.4 
 
 		 1098 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  35.99 
 
 		 1120 aa  502  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  32.52 
 
 		 1172 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  33.19 
 
 		 1126 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  32 
 
 		 1161 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  31.67 
 
 		 1166 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  33.27 
 
 		 1098 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  30.9 
 
 		 1088 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  30.36 
 
 		 1107 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  29.23 
 
 		 593 aa  211  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  29.86 
 
 		 604 aa  189  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  31.79 
 
 		 593 aa  188  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  29.46 
 
 		 583 aa  180  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  29.2 
 
 		 556 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  30.62 
 
 		 649 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  31.38 
 
 		 604 aa  175  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.45 
 
 		 551 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.96 
 
 		 1066 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  29.62 
 
 		 573 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.04 
 
 		 546 aa  158  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  30.25 
 
 		 562 aa  153  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  28.4 
 
 		 569 aa  151  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  28.98 
 
 		 577 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  29.92 
 
 		 566 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.08 
 
 		 574 aa  150  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.54 
 
 		 596 aa  148  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.36 
 
 		 803 aa  142  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.09 
 
 		 600 aa  130  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.15 
 
 		 573 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.14 
 
 		 574 aa  125  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.78 
 
 		 737 aa  124  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.22 
 
 		 585 aa  118  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.21 
 
 		 585 aa  112  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1575 aa  109  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.99 
 
 		 951 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 1127 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.84 
 
 		 657 aa  98.6  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.93 
 
 		 554 aa  98.2  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 1040 aa  96.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  25.73 
 
 		 658 aa  90.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  29.61 
 
 		 691 aa  88.2  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.14 
 
 		 499 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.92 
 
 		 655 aa  85.9  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.4 
 
 		 638 aa  84.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.61 
 
 		 655 aa  83.2  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  23.84 
 
 		 655 aa  80.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.43 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.36 
 
 		 668 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.24 
 
 		 677 aa  75.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  23.29 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.73 
 
 		 453 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  30.95 
 
 		 878 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  23.85 
 
 		 521 aa  70.1  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  33.9 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  26.16 
 
 		 685 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  26.16 
 
 		 685 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.06 
 
 		 1838 aa  65.1  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25.29 
 
 		 616 aa  65.1  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  23.48 
 
 		 667 aa  63.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 455 aa  62  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.65 
 
 		 8871 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.86 
 
 		 1126 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.2 
 
 		 3197 aa  61.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.09 
 
 		 3197 aa  61.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 		 1138 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  23.4 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1184 aa  58.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.87 
 
 		 1490 aa  57.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1133 aa  57.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  25.89 
 
 		 482 aa  57  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  24.65 
 
 		 730 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  28.81 
 
 		 645 aa  56.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.62 
 
 		 645 aa  56.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  28.16 
 
 		 646 aa  55.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.47 
 
 		 566 aa  55.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  31.51 
 
 		 590 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.29 
 
 		 1275 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.46 
 
 		 2807 aa  51.6  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.95 
 
 		 447 aa  51.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.08 
 
 		 1113 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  28.5 
 
 		 768 aa  50.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  24.31 
 
 		 404 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>