104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3029 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  39.54 
 
 		 1107 aa  637    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  45.76 
 
 		 1127 aa  893    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  38.52 
 
 		 1183 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  46.38 
 
 		 1098 aa  875    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  45.12 
 
 		 1109 aa  872    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  39.36 
 
 		 1098 aa  717    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  42.14 
 
 		 1120 aa  754    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  43.34 
 
 		 1172 aa  818    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 1088 aa  2237    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  44.96 
 
 		 1129 aa  907    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  44.25 
 
 		 1126 aa  842    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  41.64 
 
 		 1113 aa  771    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  39.13 
 
 		 1166 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  38.84 
 
 		 1161 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  39.89 
 
 		 1203 aa  718    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  39.04 
 
 		 1208 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.07 
 
 		 1114 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.17 
 
 		 1236 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.8 
 
 		 1246 aa  439  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.06 
 
 		 1208 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.9 
 
 		 1228 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.2 
 
 		 1193 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.01 
 
 		 1170 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30 
 
 		 1226 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.7 
 
 		 1192 aa  409  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.63 
 
 		 1225 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.64 
 
 		 1189 aa  359  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.81 
 
 		 1066 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.76 
 
 		 593 aa  168  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.3 
 
 		 649 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.72 
 
 		 604 aa  147  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  26.96 
 
 		 593 aa  145  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.14 
 
 		 556 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.32 
 
 		 546 aa  142  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  26.68 
 
 		 573 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.92 
 
 		 551 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.27 
 
 		 596 aa  139  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.18 
 
 		 600 aa  135  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  25.71 
 
 		 583 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  24.65 
 
 		 577 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.16 
 
 		 569 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.42 
 
 		 562 aa  121  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.55 
 
 		 574 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  25.61 
 
 		 604 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.5 
 
 		 574 aa  110  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.77 
 
 		 566 aa  107  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.29 
 
 		 737 aa  105  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  23.88 
 
 		 585 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.41 
 
 		 554 aa  103  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  21.8 
 
 		 803 aa  96.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  22.98 
 
 		 951 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1127 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.12 
 
 		 668 aa  81.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.39 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  24.3 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  24.02 
 
 		 566 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.31 
 
 		 573 aa  78.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.73 
 
 		 585 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.03 
 
 		 655 aa  75.1  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.21 
 
 		 1040 aa  74.3  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  21.93 
 
 		 878 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.56 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.47 
 
 		 645 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.05 
 
 		 638 aa  69.7  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.61 
 
 		 730 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  23.04 
 
 		 590 aa  65.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  28.92 
 
 		 691 aa  65.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.55 
 
 		 453 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.94 
 
 		 974 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  21.67 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  27.95 
 
 		 517 aa  62  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  28.96 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  27.59 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  25.95 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.65 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.49 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22 
 
 		 677 aa  55.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  26.46 
 
 		 524 aa  54.7  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  25.65 
 
 		 752 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  26.46 
 
 		 521 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.01 
 
 		 657 aa  53.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  27.57 
 
 		 438 aa  53.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.27 
 
 		 3197 aa  52.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  20.82 
 
 		 667 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  21.03 
 
 		 664 aa  52.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.07 
 
 		 2807 aa  52.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.69 
 
 		 8871 aa  52  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.1 
 
 		 447 aa  51.6  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  23.33 
 
 		 646 aa  51.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  20.4 
 
 		 655 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.34 
 
 		 604 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 1184 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.41 
 
 		 1490 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.52 
 
 		 1126 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 404 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  25.32 
 
 		 554 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  26.74 
 
 		 523 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1575 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.46 
 
 		 1275 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.57 
 
 		 3197 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>