100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1678 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 1066 aa  2191    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  29.81 
 
 		 1088 aa  181  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  31.55 
 
 		 1113 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  28.33 
 
 		 1183 aa  162  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  30.5 
 
 		 1109 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.78 
 
 		 1192 aa  158  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  26.58 
 
 		 1208 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.66 
 
 		 1129 aa  154  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.85 
 
 		 593 aa  153  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.88 
 
 		 1225 aa  151  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.42 
 
 		 1246 aa  149  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.59 
 
 		 604 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.89 
 
 		 1120 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.52 
 
 		 1208 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.96 
 
 		 1228 aa  141  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.4 
 
 		 951 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.38 
 
 		 1170 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  27.49 
 
 		 1098 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  29.16 
 
 		 1127 aa  139  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.14 
 
 		 1226 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.09 
 
 		 1189 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.61 
 
 		 1193 aa  134  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  28.33 
 
 		 1107 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.23 
 
 		 1236 aa  131  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.1 
 
 		 1203 aa  131  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.29 
 
 		 546 aa  130  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  29.05 
 
 		 1098 aa  129  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.88 
 
 		 1172 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.79 
 
 		 737 aa  126  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  27.4 
 
 		 593 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.02 
 
 		 600 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.45 
 
 		 1114 aa  123  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.2 
 
 		 554 aa  121  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.89 
 
 		 1166 aa  118  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.67 
 
 		 604 aa  116  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  26.87 
 
 		 577 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.95 
 
 		 551 aa  115  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.39 
 
 		 569 aa  115  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.39 
 
 		 649 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.29 
 
 		 803 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  28.49 
 
 		 573 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.14 
 
 		 596 aa  111  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.21 
 
 		 574 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.99 
 
 		 585 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  26.81 
 
 		 583 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  27.38 
 
 		 1126 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  27.73 
 
 		 566 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  27.31 
 
 		 730 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  27.49 
 
 		 562 aa  99  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1127 aa  96.3  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.97 
 
 		 521 aa  90.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  24.64 
 
 		 1161 aa  88.6  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  31.91 
 
 		 574 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.42 
 
 		 658 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  23.9 
 
 		 556 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.09 
 
 		 645 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  24.56 
 
 		 691 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.01 
 
 		 655 aa  75.5  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  24.91 
 
 		 655 aa  74.7  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.7 
 
 		 1040 aa  73.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1575 aa  73.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  26.28 
 
 		 492 aa  72  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.78 
 
 		 8871 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.98 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.43 
 
 		 638 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  25.29 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.98 
 
 		 2807 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.53 
 
 		 668 aa  63.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.48 
 
 		 1838 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  26.61 
 
 		 3197 aa  59.7  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.85 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.6 
 
 		 657 aa  58.9  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  26.27 
 
 		 3197 aa  58.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.29 
 
 		 1275 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  25.72 
 
 		 657 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.25 
 
 		 453 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.86 
 
 		 1490 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  20.31 
 
 		 667 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  23.08 
 
 		 681 aa  54.3  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.23 
 
 		 573 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.52 
 
 		 1019 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.48 
 
 		 1340 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  27.41 
 
 		 482 aa  52.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  24.17 
 
 		 566 aa  51.6  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  27.57 
 
 		 878 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  26.72 
 
 		 645 aa  48.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.16 
 
 		 455 aa  48.5  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.75 
 
 		 872 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  23.18 
 
 		 620 aa  47.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  26.1 
 
 		 499 aa  47.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.3 
 
 		 677 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.12 
 
 		 11716 aa  47.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  25.44 
 
 		 506 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.37 
 
 		 1118 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  24.12 
 
 		 646 aa  45.8  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1289 aa  45.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.58 
 
 		 2194 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.61 
 
 		 1222 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  30.08 
 
 		 664 aa  45.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.06 
 
 		 974 aa  44.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>