75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0695 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  51.23 
 
 		 645 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 668 aa  1353    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.85 
 
 		 638 aa  616  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  49.85 
 
 		 655 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  47.01 
 
 		 658 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  50.31 
 
 		 657 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.17 
 
 		 655 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.02 
 
 		 677 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  44.44 
 
 		 667 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  42.92 
 
 		 657 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  44.79 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  45.72 
 
 		 730 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.7 
 
 		 951 aa  117  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  23.44 
 
 		 1129 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  24.49 
 
 		 1208 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23.12 
 
 		 1183 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.35 
 
 		 1189 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  24.12 
 
 		 1088 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.9 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.21 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.88 
 
 		 600 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  25.95 
 
 		 604 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.14 
 
 		 1236 aa  77.8  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  24.75 
 
 		 1113 aa  77.8  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  23.19 
 
 		 1203 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  23.31 
 
 		 583 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  24.8 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  23.05 
 
 		 1127 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  22.9 
 
 		 556 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.68 
 
 		 1226 aa  70.5  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.72 
 
 		 1225 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  23.48 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.26 
 
 		 1193 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.93 
 
 		 1246 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.98 
 
 		 1208 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  25.79 
 
 		 1126 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.71 
 
 		 1192 aa  67.4  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.38 
 
 		 737 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  24.61 
 
 		 1098 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  23.48 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.37 
 
 		 1170 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.53 
 
 		 1066 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.08 
 
 		 604 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.76 
 
 		 1228 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  23.26 
 
 		 803 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  27.1 
 
 		 1109 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.99 
 
 		 2194 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  21.44 
 
 		 1161 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.6 
 
 		 1172 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  23.01 
 
 		 1838 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  24.65 
 
 		 1107 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  26.88 
 
 		 1098 aa  57.4  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.61 
 
 		 1114 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  23.94 
 
 		 577 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.38 
 
 		 492 aa  54.3  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  24.19 
 
 		 1166 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  25.38 
 
 		 649 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  25.64 
 
 		 1120 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.11 
 
 		 1118 aa  50.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.08 
 
 		 1490 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  23.21 
 
 		 585 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.26 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.11 
 
 		 1340 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.25 
 
 		 1222 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  24.21 
 
 		 562 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.79 
 
 		 1113 aa  47.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.31 
 
 		 1040 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.16 
 
 		 551 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25 
 
 		 521 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.85 
 
 		 1225 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  23.23 
 
 		 1346 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  23.62 
 
 		 574 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  25.51 
 
 		 1348 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.74 
 
 		 546 aa  43.9  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.54 
 
 		 453 aa  43.9  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>