113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2953 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  59.75 
 
 		 1225 aa  1292    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  59.46 
 
 		 1236 aa  1326    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  52.56 
 
 		 1193 aa  1137    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  58.29 
 
 		 1208 aa  1285    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.88 
 
 		 1228 aa  1384    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  61.33 
 
 		 1246 aa  1355    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  60.78 
 
 		 1192 aa  1324    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  45.43 
 
 		 1114 aa  850    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 1170 aa  2343    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  57.13 
 
 		 1226 aa  1266    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.92 
 
 		 1189 aa  884    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  36.15 
 
 		 1183 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  34.99 
 
 		 1203 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  35.96 
 
 		 1120 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  34.15 
 
 		 1208 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  33.36 
 
 		 1127 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  33.68 
 
 		 1113 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  33.55 
 
 		 1129 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  36.8 
 
 		 1098 aa  499  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  32.65 
 
 		 1166 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  32.32 
 
 		 1172 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  31.64 
 
 		 1109 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  31.81 
 
 		 1161 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  32.01 
 
 		 1088 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  32.73 
 
 		 1126 aa  453  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  32.5 
 
 		 1098 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  31.48 
 
 		 1107 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  33.94 
 
 		 593 aa  220  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  30.55 
 
 		 593 aa  201  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.02 
 
 		 551 aa  191  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  30.86 
 
 		 604 aa  191  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.9 
 
 		 546 aa  184  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  31.64 
 
 		 583 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  30.36 
 
 		 649 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.62 
 
 		 596 aa  164  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.94 
 
 		 556 aa  164  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  30.66 
 
 		 562 aa  164  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  31.46 
 
 		 604 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.8 
 
 		 1066 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.83 
 
 		 600 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  29.96 
 
 		 577 aa  154  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.35 
 
 		 574 aa  152  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  30 
 
 		 569 aa  151  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  28.21 
 
 		 573 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  30.36 
 
 		 566 aa  147  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.09 
 
 		 803 aa  145  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.4 
 
 		 737 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.9 
 
 		 573 aa  118  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.26 
 
 		 585 aa  118  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.79 
 
 		 1040 aa  107  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  37.08 
 
 		 574 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1127 aa  104  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.22 
 
 		 585 aa  104  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1575 aa  102  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  31.23 
 
 		 499 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.66 
 
 		 655 aa  96.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.69 
 
 		 492 aa  96.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  33.15 
 
 		 878 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.63 
 
 		 554 aa  87.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  25.49 
 
 		 681 aa  87.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.51 
 
 		 951 aa  85.9  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.45 
 
 		 453 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.5 
 
 		 668 aa  83.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.5 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  25.25 
 
 		 646 aa  77  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.38 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.18 
 
 		 655 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  25.34 
 
 		 655 aa  73.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  29.05 
 
 		 691 aa  73.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.25 
 
 		 455 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  24.44 
 
 		 658 aa  70.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  22.75 
 
 		 667 aa  66.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.31 
 
 		 1838 aa  65.1  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  31.25 
 
 		 482 aa  63.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.94 
 
 		 1126 aa  62.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.02 
 
 		 1138 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 1184 aa  60.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.53 
 
 		 1019 aa  59.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.82 
 
 		 2807 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.51 
 
 		 8871 aa  59.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  22.79 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  23.35 
 
 		 685 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.2 
 
 		 1275 aa  58.9  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.22 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.32 
 
 		 526 aa  57.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.5 
 
 		 3197 aa  57  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  22.93 
 
 		 657 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.75 
 
 		 638 aa  56.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.06 
 
 		 616 aa  56.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.72 
 
 		 1113 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.14 
 
 		 974 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25 
 
 		 1490 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  31.01 
 
 		 645 aa  54.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.79 
 
 		 645 aa  52.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  26.39 
 
 		 566 aa  52.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.05 
 
 		 469 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  25.62 
 
 		 730 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  25.98 
 
 		 437 aa  50.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.59 
 
 		 3197 aa  50.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  26.62 
 
 		 447 aa  49.7  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>