66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2699 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 
655 aa  1322    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  64.23 
 
 
655 aa  835    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.86 
 
 
657 aa  803    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  52.53 
 
 
677 aa  673    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  65.86 
 
 
658 aa  900    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  50.15 
 
 
645 aa  595  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  46.93 
 
 
667 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  48.17 
 
 
668 aa  570  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  47.77 
 
 
638 aa  555  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  43.75 
 
 
657 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  40.8 
 
 
620 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  41.02 
 
 
730 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.73 
 
 
951 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.3 
 
 
600 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.36 
 
 
554 aa  99  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  25.27 
 
 
593 aa  94.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.38 
 
 
604 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  24.14 
 
 
604 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.38 
 
 
593 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.01 
 
 
1066 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.57 
 
 
1228 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  26.65 
 
 
577 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.19 
 
 
1225 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  24.45 
 
 
556 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.48 
 
 
1208 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  24.04 
 
 
583 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.23 
 
 
1236 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.87 
 
 
1189 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.88 
 
 
569 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.92 
 
 
1192 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  22.85 
 
 
1129 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  26.6 
 
 
562 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.99 
 
 
1226 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  23.85 
 
 
1107 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  24.01 
 
 
1208 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.56 
 
 
1246 aa  60.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.46 
 
 
1170 aa  60.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.61 
 
 
546 aa  58.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  23.95 
 
 
649 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.62 
 
 
1114 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  22.17 
 
 
1183 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  23.08 
 
 
566 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  22.53 
 
 
585 aa  54.3  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  26.51 
 
 
1098 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.56 
 
 
737 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  23.96 
 
 
573 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.64 
 
 
1289 aa  51.2  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  23.04 
 
 
1127 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  20.4 
 
 
1088 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.28 
 
 
1340 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  25 
 
 
1166 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  23.53 
 
 
1098 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.87 
 
 
492 aa  48.9  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  23.67 
 
 
1113 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.14 
 
 
551 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  21.71 
 
 
1203 aa  47.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.84 
 
 
453 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.1 
 
 
574 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  34.94 
 
 
691 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.53 
 
 
1193 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25 
 
 
2194 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  24.28 
 
 
413 aa  44.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.14 
 
 
1113 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  40.48 
 
 
1126 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.24 
 
 
574 aa  43.9  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  23.63 
 
 
1161 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>