116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1438 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 593 aa  1193    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  45 
 
 		 604 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  41.54 
 
 		 569 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  40.62 
 
 		 649 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  41.34 
 
 		 546 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  39.02 
 
 		 556 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  39.33 
 
 		 593 aa  333  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  43.34 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  41.42 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  38.34 
 
 		 604 aa  323  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  38.36 
 
 		 573 aa  312  9e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  39.23 
 
 		 574 aa  303  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.5 
 
 		 600 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  39.49 
 
 		 583 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  37.32 
 
 		 577 aa  297  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  36.03 
 
 		 562 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  34.01 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.77 
 
 		 585 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.06 
 
 		 1192 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.94 
 
 		 1170 aa  200  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.05 
 
 		 1193 aa  197  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  34.53 
 
 		 803 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  33.45 
 
 		 1098 aa  193  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.11 
 
 		 1208 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.1 
 
 		 1226 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.39 
 
 		 1246 aa  179  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 1127 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1575 aa  179  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.24 
 
 		 1189 aa  177  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.22 
 
 		 1236 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.49 
 
 		 1225 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.76 
 
 		 1088 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.28 
 
 		 1114 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  28.37 
 
 		 1183 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  29.98 
 
 		 1113 aa  160  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.79 
 
 		 1228 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  28.19 
 
 		 1109 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  26.25 
 
 		 1129 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.85 
 
 		 1066 aa  153  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.97 
 
 		 1120 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.38 
 
 		 737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  26.04 
 
 		 1208 aa  143  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  29.09 
 
 		 585 aa  141  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.73 
 
 		 1127 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.59 
 
 		 1126 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  33.53 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  27.5 
 
 		 1098 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.52 
 
 		 1166 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  26.64 
 
 		 1107 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.27 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.97 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  27.27 
 
 		 691 aa  113  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25.7 
 
 		 1172 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.87 
 
 		 1203 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.7 
 
 		 951 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.72 
 
 		 455 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  28.1 
 
 		 521 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.01 
 
 		 655 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  24.43 
 
 		 1161 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  28.37 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.43 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.12 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.17 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.38 
 
 		 655 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  24.62 
 
 		 878 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.89 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.65 
 
 		 1040 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  23.24 
 
 		 685 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  23.24 
 
 		 685 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.8 
 
 		 668 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  25.89 
 
 		 590 aa  71.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 1184 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.78 
 
 		 1838 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  25.54 
 
 		 566 aa  67.4  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.7 
 
 		 677 aa  67  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.3 
 
 		 3197 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.62 
 
 		 1019 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.88 
 
 		 8871 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  29.34 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.3 
 
 		 1126 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  23.35 
 
 		 655 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.52 
 
 		 604 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  25.18 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  27.42 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.42 
 
 		 1275 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  25.26 
 
 		 646 aa  58.9  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.69 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 1138 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.88 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  26.1 
 
 		 4379 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.72 
 
 		 1490 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  29.7 
 
 		 664 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  30.81 
 
 		 645 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.37 
 
 		 3197 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.89 
 
 		 638 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.84 
 
 		 1124 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.15 
 
 		 872 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  26.51 
 
 		 447 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  24.21 
 
 		 554 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  23.61 
 
 		 758 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>