121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1617 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 600 aa  1224    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  36.56 
 
 		 573 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  36.73 
 
 		 604 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  38.94 
 
 		 562 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  39.79 
 
 		 569 aa  330  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  37.57 
 
 		 649 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  35.98 
 
 		 593 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  37.09 
 
 		 583 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  36.83 
 
 		 577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  35.75 
 
 		 556 aa  306  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  38.5 
 
 		 593 aa  301  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.77 
 
 		 551 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.93 
 
 		 546 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.97 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  36.36 
 
 		 574 aa  270  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.97 
 
 		 574 aa  264  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  34.18 
 
 		 604 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.14 
 
 		 585 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.38 
 
 		 1208 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.07 
 
 		 1193 aa  156  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.11 
 
 		 1236 aa  154  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.16 
 
 		 1192 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.68 
 
 		 803 aa  150  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.06 
 
 		 1129 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.22 
 
 		 1189 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.44 
 
 		 1114 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  28.89 
 
 		 1120 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.71 
 
 		 1208 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.82 
 
 		 1225 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.91 
 
 		 1166 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.83 
 
 		 1170 aa  140  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.81 
 
 		 1098 aa  136  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  26.18 
 
 		 1088 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  28.36 
 
 		 951 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.72 
 
 		 737 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.34 
 
 		 585 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.95 
 
 		 1226 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  26.17 
 
 		 1183 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.93 
 
 		 1126 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.02 
 
 		 1066 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  25.48 
 
 		 1161 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1127 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  26.88 
 
 		 1113 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.86 
 
 		 1246 aa  121  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.8 
 
 		 1127 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.51 
 
 		 655 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.1 
 
 		 1172 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.3 
 
 		 1109 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.04 
 
 		 1203 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.49 
 
 		 1098 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.4 
 
 		 1228 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  27.26 
 
 		 691 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1575 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  27.52 
 
 		 1107 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.47 
 
 		 453 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.49 
 
 		 499 aa  97.8  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  27.37 
 
 		 658 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.44 
 
 		 1040 aa  94  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.25 
 
 		 645 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.35 
 
 		 554 aa  91.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  27.45 
 
 		 730 aa  87  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  26.22 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  28.44 
 
 		 566 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  25.44 
 
 		 655 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.54 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.73 
 
 		 655 aa  79.7  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  27.96 
 
 		 521 aa  80.1  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.72 
 
 		 638 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.88 
 
 		 668 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.9 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  25.43 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.83 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.53 
 
 		 573 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  25.27 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  30.6 
 
 		 664 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.77 
 
 		 677 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1184 aa  71.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  25.47 
 
 		 667 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.69 
 
 		 1838 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.04 
 
 		 1113 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  25.1 
 
 		 685 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  25.1 
 
 		 685 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.06 
 
 		 1222 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 1340 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  34.39 
 
 		 878 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.33 
 
 		 1275 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  27.62 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.94 
 
 		 1019 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.86 
 
 		 872 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.12 
 
 		 1126 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.77 
 
 		 1118 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.04 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1289 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  26.84 
 
 		 1124 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.69 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.41 
 
 		 1225 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  24.89 
 
 		 566 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  27.97 
 
 		 386 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  25.34 
 
 		 590 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.78 
 
 		 1557 aa  54.7  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>