102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4979 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  44.46 
 
 
1127 aa  867    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  37.95 
 
 
1183 aa  698    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  100 
 
 
1098 aa  2241    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  41.86 
 
 
1109 aa  801    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  37.58 
 
 
1098 aa  653    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  40.99 
 
 
1120 aa  710    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  42.13 
 
 
1172 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  46.38 
 
 
1088 aa  917    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  41.51 
 
 
1129 aa  810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  51.16 
 
 
1126 aa  1038    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  41.77 
 
 
1113 aa  752    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  38.76 
 
 
1166 aa  695    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  38.05 
 
 
1161 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  37.09 
 
 
1203 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  36.84 
 
 
1208 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  38.57 
 
 
1107 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.26 
 
 
1114 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.97 
 
 
1246 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.88 
 
 
1208 aa  483  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.27 
 
 
1228 aa  470  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.91 
 
 
1226 aa  464  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.75 
 
 
1236 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.29 
 
 
1193 aa  450  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.75 
 
 
1170 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.35 
 
 
1192 aa  443  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.54 
 
 
1225 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.45 
 
 
1189 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  27.43 
 
 
593 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  29.34 
 
 
556 aa  165  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.97 
 
 
596 aa  154  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.05 
 
 
1066 aa  151  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  27.84 
 
 
573 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  26.66 
 
 
604 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.5 
 
 
593 aa  147  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.56 
 
 
649 aa  137  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.96 
 
 
551 aa  136  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  28.18 
 
 
569 aa  135  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.46 
 
 
546 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.46 
 
 
600 aa  130  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.29 
 
 
585 aa  122  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.08 
 
 
604 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  29.13 
 
 
562 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.21 
 
 
554 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.93 
 
 
566 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  25.04 
 
 
583 aa  112  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  24.78 
 
 
577 aa  111  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.59 
 
 
574 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.13 
 
 
573 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.34 
 
 
803 aa  96.3  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  31.98 
 
 
574 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.24 
 
 
951 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.19 
 
 
737 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  23.99 
 
 
492 aa  83.2  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.05 
 
 
668 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.4 
 
 
638 aa  80.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 
1127 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  23.9 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.93 
 
 
645 aa  74.7  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  29.19 
 
 
1575 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  21.79 
 
 
730 aa  71.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.32 
 
 
1040 aa  70.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.63 
 
 
585 aa  68.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  26.33 
 
 
499 aa  67  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.27 
 
 
526 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  21.46 
 
 
655 aa  63.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  22.86 
 
 
566 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.72 
 
 
655 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  22.43 
 
 
878 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.62 
 
 
453 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  29.75 
 
 
590 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  26.55 
 
 
768 aa  57  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  25.96 
 
 
482 aa  57  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.98 
 
 
691 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  23.6 
 
 
447 aa  56.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.27 
 
 
657 aa  55.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.59 
 
 
658 aa  55.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  26.03 
 
 
616 aa  55.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.94 
 
 
455 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29 
 
 
604 aa  54.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.69 
 
 
655 aa  53.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.74 
 
 
681 aa  52.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.27 
 
 
1557 aa  52.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  23.62 
 
 
828 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.9 
 
 
1490 aa  52.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  28.35 
 
 
646 aa  51.6  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  28.45 
 
 
645 aa  51.6  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  29.53 
 
 
1275 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  22.75 
 
 
657 aa  48.9  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.91 
 
 
472 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  23.38 
 
 
386 aa  47.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
1184 aa  48.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  22.93 
 
 
685 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.09 
 
 
1019 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  25.79 
 
 
664 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  22.93 
 
 
685 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  23.17 
 
 
1289 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.86 
 
 
2807 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  28.8 
 
 
758 aa  46.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.9 
 
 
11716 aa  45.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.4 
 
 
8871 aa  45.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>