62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7001 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  61.76 
 
 
655 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  61.36 
 
 
657 aa  801    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  50.61 
 
 
677 aa  670    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  100 
 
 
658 aa  1342    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  65.86 
 
 
655 aa  900    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  47.79 
 
 
667 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.63 
 
 
645 aa  604  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.02 
 
 
638 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  47.01 
 
 
668 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  45.36 
 
 
657 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  38.1 
 
 
620 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  38.4 
 
 
730 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.04 
 
 
951 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.37 
 
 
600 aa  95.9  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  25.28 
 
 
593 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.09 
 
 
554 aa  87.8  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.42 
 
 
1066 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  25.16 
 
 
604 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.68 
 
 
1228 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  23.89 
 
 
593 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  23.24 
 
 
604 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  21.47 
 
 
1208 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.31 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23.39 
 
 
1183 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.32 
 
 
1246 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  22.69 
 
 
1129 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.97 
 
 
1189 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.61 
 
 
1208 aa  68.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.62 
 
 
1192 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.42 
 
 
1113 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.92 
 
 
1225 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  23.76 
 
 
577 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  22.06 
 
 
1203 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.94 
 
 
1226 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  21.67 
 
 
1088 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.02 
 
 
546 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.04 
 
 
562 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.25 
 
 
1236 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  23.68 
 
 
1127 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.52 
 
 
1170 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  23.21 
 
 
556 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.96 
 
 
492 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  24.2 
 
 
566 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  22.92 
 
 
649 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.87 
 
 
521 aa  55.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.58 
 
 
1193 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  21.32 
 
 
1107 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  23.77 
 
 
1166 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  24.07 
 
 
691 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  22.43 
 
 
585 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.57 
 
 
574 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  22.29 
 
 
1109 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  24.88 
 
 
1098 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  23.7 
 
 
1161 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  27.61 
 
 
1098 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25.39 
 
 
1172 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.63 
 
 
737 aa  47.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  22.35 
 
 
583 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.94 
 
 
1114 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  22.44 
 
 
1120 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  23.15 
 
 
573 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  27.43 
 
 
1126 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>