114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1760 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  44.04 
 
 		 1166 aa  922    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  43.95 
 
 		 1113 aa  867    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  40.29 
 
 		 1129 aa  792    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  40.22 
 
 		 1203 aa  783    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  39.03 
 
 		 1208 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  40.44 
 
 		 1126 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  44.68 
 
 		 1107 aa  838    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  42.51 
 
 		 1127 aa  828    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  40.19 
 
 		 1183 aa  787    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  40.71 
 
 		 1098 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  41.61 
 
 		 1109 aa  806    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  46.08 
 
 		 1161 aa  947    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  51.36 
 
 		 1098 aa  955    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 1120 aa  2242    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  41.11 
 
 		 1172 aa  741    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  42.07 
 
 		 1088 aa  798    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.74 
 
 		 1192 aa  532  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.96 
 
 		 1170 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.34 
 
 		 1114 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.9 
 
 		 1193 aa  515  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.34 
 
 		 1236 aa  508  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.73 
 
 		 1228 aa  508  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.31 
 
 		 1246 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.46 
 
 		 1226 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.21 
 
 		 1208 aa  485  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.92 
 
 		 1225 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.73 
 
 		 1189 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  29.19 
 
 		 593 aa  206  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  31.1 
 
 		 573 aa  197  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  31.82 
 
 		 577 aa  181  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  28.37 
 
 		 649 aa  180  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  28.43 
 
 		 556 aa  177  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  29.97 
 
 		 593 aa  171  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.13 
 
 		 546 aa  168  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.89 
 
 		 600 aa  165  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.84 
 
 		 604 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.89 
 
 		 1066 aa  162  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.26 
 
 		 596 aa  160  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  28.85 
 
 		 585 aa  149  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  29.57 
 
 		 569 aa  148  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  29.17 
 
 		 604 aa  144  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  29.87 
 
 		 562 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  29.26 
 
 		 583 aa  142  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.66 
 
 		 551 aa  137  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.33 
 
 		 574 aa  131  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  29.69 
 
 		 566 aa  131  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.92 
 
 		 951 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.55 
 
 		 573 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  34.83 
 
 		 574 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.33 
 
 		 737 aa  110  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  28.24 
 
 		 492 aa  107  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.79 
 
 		 803 aa  104  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1127 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  27.1 
 
 		 521 aa  96.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.99 
 
 		 554 aa  89  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27 
 
 		 585 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26.79 
 
 		 691 aa  82  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  29.62 
 
 		 499 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1575 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.91 
 
 		 1040 aa  76.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  28.72 
 
 		 878 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  23.61 
 
 		 681 aa  69.3  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.54 
 
 		 668 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.29 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  25.73 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.46 
 
 		 1838 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.57 
 
 		 526 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  25.47 
 
 		 730 aa  64.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.87 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.38 
 
 		 1490 aa  62  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  22.76 
 
 		 655 aa  62  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  31.58 
 
 		 590 aa  62  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.17 
 
 		 655 aa  60.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.13 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  30.28 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  35.71 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.17 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.18 
 
 		 8871 aa  58.9  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.67 
 
 		 1019 aa  57.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.17 
 
 		 2807 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.34 
 
 		 437 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  25.44 
 
 		 685 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  27.41 
 
 		 438 aa  55.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  25.44 
 
 		 685 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.02 
 
 		 638 aa  55.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  32.14 
 
 		 664 aa  55.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.66 
 
 		 645 aa  55.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  27.49 
 
 		 768 aa  55.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  23.54 
 
 		 655 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  26.55 
 
 		 469 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  23.23 
 
 		 667 aa  52  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  30.52 
 
 		 435 aa  51.6  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  24.26 
 
 		 1557 aa  51.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  25.28 
 
 		 657 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  24.04 
 
 		 1275 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  26.48 
 
 		 3197 aa  49.3  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.94 
 
 		 1126 aa  49.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.94 
 
 		 657 aa  48.9  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 1184 aa  49.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>