66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8247 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  100 
 
 
730 aa  1419    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  43.41 
 
 
645 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  43.14 
 
 
638 aa  402  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  45.59 
 
 
620 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  45.32 
 
 
668 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  43.21 
 
 
655 aa  347  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.88 
 
 
657 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.59 
 
 
655 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  39.08 
 
 
677 aa  330  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  37.94 
 
 
658 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  37.66 
 
 
657 aa  293  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  38.15 
 
 
667 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.31 
 
 
1066 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  34.56 
 
 
554 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  30.69 
 
 
951 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.45 
 
 
600 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.85 
 
 
1129 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  26.98 
 
 
573 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  26.18 
 
 
1127 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  22.91 
 
 
1088 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  28.35 
 
 
604 aa  70.9  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.41 
 
 
556 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.41 
 
 
1193 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.65 
 
 
546 aa  67.8  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  28.7 
 
 
1172 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.86 
 
 
1109 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.92 
 
 
1189 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.45 
 
 
1246 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.73 
 
 
604 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  24.01 
 
 
1098 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.92 
 
 
1208 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  24.22 
 
 
593 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  28.85 
 
 
1098 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.42 
 
 
1236 aa  62  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  26.98 
 
 
1120 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  25.81 
 
 
593 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  22.45 
 
 
1183 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.83 
 
 
1225 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.87 
 
 
551 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.4 
 
 
1114 aa  57.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  24.02 
 
 
1203 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.24 
 
 
569 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.74 
 
 
649 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.2 
 
 
691 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  22.68 
 
 
1208 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  25 
 
 
1161 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  23.49 
 
 
1126 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  30.13 
 
 
574 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  30.88 
 
 
386 aa  51.6  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.68 
 
 
1226 aa  50.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.09 
 
 
1838 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.74 
 
 
1228 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.52 
 
 
1192 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  24.3 
 
 
1113 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.43 
 
 
2194 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.08 
 
 
492 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  24.64 
 
 
583 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  25.63 
 
 
803 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  25.19 
 
 
1166 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.23 
 
 
2807 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.2 
 
 
1040 aa  45.4  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  23.81 
 
 
566 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 
1225 aa  44.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.65 
 
 
596 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  27.1 
 
 
562 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  23.19 
 
 
1107 aa  44.3  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>