110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1751 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 		 737 aa  1494    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  46.54 
 
 		 803 aa  544  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  30.12 
 
 		 593 aa  183  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  30.88 
 
 		 569 aa  173  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  28.65 
 
 		 556 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  29.69 
 
 		 604 aa  154  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  31.38 
 
 		 593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  29.57 
 
 		 649 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  30.07 
 
 		 573 aa  144  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.68 
 
 		 551 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  30.89 
 
 		 577 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.44 
 
 		 562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.34 
 
 		 546 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.53 
 
 		 1192 aa  134  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.72 
 
 		 600 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.76 
 
 		 1114 aa  131  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.36 
 
 		 1246 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.04 
 
 		 596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.79 
 
 		 1066 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  30.6 
 
 		 604 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.06 
 
 		 1225 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.52 
 
 		 574 aa  125  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.49 
 
 		 583 aa  124  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.26 
 
 		 1189 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.56 
 
 		 1193 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.57 
 
 		 574 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.4 
 
 		 1170 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.07 
 
 		 1129 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.55 
 
 		 1228 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.46 
 
 		 1226 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  33.33 
 
 		 1098 aa  111  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.27 
 
 		 1208 aa  110  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1127 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.98 
 
 		 1208 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.29 
 
 		 1088 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1575 aa  104  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.72 
 
 		 1236 aa  104  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.84 
 
 		 585 aa  99.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.72 
 
 		 585 aa  95.9  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.4 
 
 		 1203 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  28.64 
 
 		 1120 aa  94.4  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  32 
 
 		 1127 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  33.47 
 
 		 1183 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.76 
 
 		 1040 aa  91.3  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  26.89 
 
 		 1113 aa  90.9  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  28.69 
 
 		 1126 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  25.72 
 
 		 1161 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  29.28 
 
 		 1098 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.33 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  25.11 
 
 		 681 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  24.86 
 
 		 1107 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.93 
 
 		 1838 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.79 
 
 		 1109 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.67 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  28.37 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  28.91 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  24.1 
 
 		 1172 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  23.27 
 
 		 655 aa  68.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.15 
 
 		 1126 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  24.73 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  24.86 
 
 		 951 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.38 
 
 		 668 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  28.99 
 
 		 1490 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.59 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.26 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  23.65 
 
 		 685 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  23.65 
 
 		 685 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.3 
 
 		 2807 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  31.93 
 
 		 3197 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  22.38 
 
 		 1166 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  24.3 
 
 		 878 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  30 
 
 		 974 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  27.19 
 
 		 590 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  25.71 
 
 		 1275 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  30.69 
 
 		 4379 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  28.61 
 
 		 604 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  28.1 
 
 		 872 aa  57.4  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.82 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.3 
 
 		 566 aa  55.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  27.85 
 
 		 813 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  31.91 
 
 		 492 aa  54.7  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.84 
 
 		 1222 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  33.99 
 
 		 645 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.3 
 
 		 1118 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.24 
 
 		 891 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.26 
 
 		 657 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.82 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.65 
 
 		 1113 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.56 
 
 		 655 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  24.11 
 
 		 664 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1184 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.19 
 
 		 455 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  33.33 
 
 		 752 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  28.76 
 
 		 646 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.68 
 
 		 1340 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.17 
 
 		 3197 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25.77 
 
 		 616 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  28.64 
 
 		 554 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  24.93 
 
 		 482 aa  47.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.82 
 
 		 11716 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>