26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0593 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 620 aa  1228    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.41 
 
 		 638 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  44.79 
 
 		 668 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  41.64 
 
 		 645 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  41.27 
 
 		 677 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  42.66 
 
 		 655 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.8 
 
 		 655 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  46.86 
 
 		 730 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  38.1 
 
 		 658 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  38.47 
 
 		 667 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  43.28 
 
 		 657 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  36.5 
 
 		 657 aa  356  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.64 
 
 		 951 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.07 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.62 
 
 		 600 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  24.71 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  23.62 
 
 		 573 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.07 
 
 		 604 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.66 
 
 		 585 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.18 
 
 		 1066 aa  47.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  23.2 
 
 		 1127 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  23.79 
 
 		 1120 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.56 
 
 		 11716 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  22 
 
 		 1129 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.03 
 
 		 1838 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  25.33 
 
 		 1098 aa  43.9  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>