38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6360 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 657 aa  1347    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.71 
 
 		 677 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  51.83 
 
 		 667 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  45.36 
 
 		 658 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  44.72 
 
 		 655 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  43.75 
 
 		 655 aa  532  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  45.45 
 
 		 657 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  42.92 
 
 		 668 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  41.45 
 
 		 638 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  39.81 
 
 		 645 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  36.5 
 
 		 620 aa  356  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  37.48 
 
 		 730 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.17 
 
 		 951 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  22.08 
 
 		 1129 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  24.73 
 
 		 1183 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 1193 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.72 
 
 		 1066 aa  57.4  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  25.14 
 
 		 1107 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  23.06 
 
 		 573 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.53 
 
 		 1208 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.79 
 
 		 1225 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.29 
 
 		 1114 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.79 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.14 
 
 		 554 aa  53.5  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  21.32 
 
 		 1109 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.8 
 
 		 569 aa  50.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.49 
 
 		 593 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  22.89 
 
 		 1161 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  26.06 
 
 		 1120 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  20 
 
 		 566 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.38 
 
 		 1192 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  22.86 
 
 		 604 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.4 
 
 		 1228 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  22.55 
 
 		 1088 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  22.94 
 
 		 556 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  24.6 
 
 		 1098 aa  44.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  22.49 
 
 		 803 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  22.75 
 
 		 1126 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>