60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0555 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  48.71 
 
 		 657 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  53.05 
 
 		 655 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  52.12 
 
 		 667 aa  670    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  53.45 
 
 		 657 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 677 aa  1365    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  50.61 
 
 		 658 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  52.53 
 
 		 655 aa  673    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  46.02 
 
 		 668 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  44 
 
 		 645 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.95 
 
 		 638 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  41.27 
 
 		 620 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  40.04 
 
 		 730 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.65 
 
 		 951 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.52 
 
 		 554 aa  87.4  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.77 
 
 		 600 aa  72  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.02 
 
 		 604 aa  71.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  24.35 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.7 
 
 		 1225 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.35 
 
 		 1236 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 1226 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23.22 
 
 		 1183 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.7 
 
 		 593 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.06 
 
 		 569 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.41 
 
 		 1228 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  25.05 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.99 
 
 		 1189 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  24.51 
 
 		 604 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  22.67 
 
 		 1129 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.81 
 
 		 1208 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.4 
 
 		 1170 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  22 
 
 		 1088 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  23.66 
 
 		 1113 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  23.6 
 
 		 583 aa  54.3  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  23.65 
 
 		 691 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.32 
 
 		 1114 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  24.16 
 
 		 577 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  25.12 
 
 		 1098 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.22 
 
 		 1192 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.38 
 
 		 1193 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  22.05 
 
 		 1127 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  23.66 
 
 		 1166 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.46 
 
 		 1246 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  24 
 
 		 1120 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  21.54 
 
 		 1203 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  22.22 
 
 		 1107 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.73 
 
 		 2194 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.27 
 
 		 1113 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.19 
 
 		 1222 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.68 
 
 		 492 aa  47.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.19 
 
 		 453 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.43 
 
 		 1066 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.88 
 
 		 889 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  22.66 
 
 		 1172 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  22.66 
 
 		 1161 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.76 
 
 		 1838 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  20.22 
 
 		 1109 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.19 
 
 		 1340 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  36.73 
 
 		 1126 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  27.4 
 
 		 1557 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.14 
 
 		 551 aa  43.9  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>