115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0824 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  100 
 
 
556 aa  1129    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  51.4 
 
 
649 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  46.63 
 
 
593 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  46.11 
 
 
583 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  45.52 
 
 
604 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  40.41 
 
 
569 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  40.91 
 
 
573 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  41.82 
 
 
562 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  43.12 
 
 
551 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  39.02 
 
 
593 aa  333  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.22 
 
 
596 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.33 
 
 
546 aa  314  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  38.65 
 
 
577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.25 
 
 
600 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.84 
 
 
574 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  37.04 
 
 
574 aa  279  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  34.07 
 
 
604 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.22 
 
 
585 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  30.1 
 
 
803 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.89 
 
 
1208 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  28.6 
 
 
1129 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.14 
 
 
1114 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  28.76 
 
 
1098 aa  177  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  28.07 
 
 
1109 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.77 
 
 
1193 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
1127 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.87 
 
 
1189 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.48 
 
 
1246 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  28.43 
 
 
1120 aa  160  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.29 
 
 
1236 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.2 
 
 
1228 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.65 
 
 
737 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  29.36 
 
 
1107 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.37 
 
 
1127 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  29.34 
 
 
1098 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  29.31 
 
 
1575 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.94 
 
 
1170 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.36 
 
 
1225 aa  143  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.06 
 
 
1192 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  26.14 
 
 
1088 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  28.42 
 
 
951 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.15 
 
 
1208 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  27.32 
 
 
1183 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.57 
 
 
1161 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.47 
 
 
1126 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  27.39 
 
 
1166 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.68 
 
 
1226 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.57 
 
 
526 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.06 
 
 
1172 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  28.34 
 
 
521 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26 
 
 
691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.89 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  25.55 
 
 
1113 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.84 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  30.93 
 
 
655 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.12 
 
 
554 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  23.44 
 
 
585 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
1184 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.87 
 
 
1203 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.6 
 
 
455 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  25.79 
 
 
492 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  33.91 
 
 
878 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  23.22 
 
 
681 aa  87.8  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.3 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.9 
 
 
1066 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.6 
 
 
1040 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.25 
 
 
657 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  26.62 
 
 
590 aa  73.9  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.15 
 
 
638 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.75 
 
 
655 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  22.9 
 
 
668 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  25.38 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  26.24 
 
 
730 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  29.52 
 
 
646 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.45 
 
 
655 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  30.14 
 
 
1019 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.16 
 
 
1126 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.87 
 
 
645 aa  64.7  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  27.09 
 
 
469 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.05 
 
 
677 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 
1138 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.13 
 
 
1275 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  29.08 
 
 
645 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  24.7 
 
 
566 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  26.97 
 
 
685 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  26.97 
 
 
685 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.21 
 
 
658 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.82 
 
 
573 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.24 
 
 
3197 aa  57.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  28.81 
 
 
3197 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.11 
 
 
472 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  26.74 
 
 
664 aa  57.4  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  27.63 
 
 
872 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  25.4 
 
 
1124 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  25.57 
 
 
828 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.87 
 
 
1490 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.51 
 
 
1222 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.15 
 
 
889 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
1104 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.07 
 
 
1838 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>