137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2897 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  100 
 
 		 1575 aa  3206    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  32.34 
 
 		 593 aa  199  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  31.4 
 
 		 593 aa  175  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  31.93 
 
 		 604 aa  171  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  28.11 
 
 		 556 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.47 
 
 		 551 aa  158  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.75 
 
 		 546 aa  153  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  30.41 
 
 		 803 aa  153  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  29.65 
 
 		 649 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  28.38 
 
 		 569 aa  144  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.58 
 
 		 1236 aa  141  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.44 
 
 		 1225 aa  137  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  29.26 
 
 		 583 aa  135  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  28.83 
 
 		 655 aa  133  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.78 
 
 		 600 aa  133  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.04 
 
 		 1192 aa  133  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.64 
 
 		 596 aa  131  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1127 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  28.63 
 
 		 585 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.17 
 
 		 574 aa  129  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.97 
 
 		 1208 aa  124  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1394 aa  123  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.97 
 
 		 1170 aa  123  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.04 
 
 		 1226 aa  123  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1647  hypothetical protein  35.61 
 
 		 639 aa  121  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.201062  normal  0.0771148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.18 
 
 		 1246 aa  119  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.22 
 
 		 737 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  25.84 
 
 		 604 aa  117  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 1114 aa  117  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  26.26 
 
 		 763 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  31.09 
 
 		 499 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.83 
 
 		 577 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  28.88 
 
 		 573 aa  110  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  31.65 
 
 		 878 aa  102  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.43 
 
 		 1129 aa  101  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  26.65 
 
 		 1118 aa  100  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.42 
 
 		 574 aa  100  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.74 
 
 		 1838 aa  97.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.27 
 
 		 1193 aa  97.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  30.71 
 
 		 1126 aa  95.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.14 
 
 		 1189 aa  93.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  23.04 
 
 		 1088 aa  91.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  25.89 
 
 		 562 aa  91.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.58 
 
 		 1228 aa  90.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  32.21 
 
 		 1120 aa  90.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.1 
 
 		 1127 aa  89.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.83 
 
 		 1275 aa  89.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.35 
 
 		 681 aa  89  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.81 
 
 		 1066 aa  89  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  23.81 
 
 		 1109 aa  88.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  32.94 
 
 		 8871 aa  86.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26.47 
 
 		 691 aa  85.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  33.06 
 
 		 1113 aa  84.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  23.06 
 
 		 951 aa  84.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  24.11 
 
 		 1098 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1184 aa  83.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.07 
 
 		 453 aa  81.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  23.17 
 
 		 1208 aa  81.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  31.32 
 
 		 846 aa  80.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.19 
 
 		 585 aa  80.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  28.8 
 
 		 872 aa  77.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  22.51 
 
 		 1183 aa  77  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  25.36 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  29.76 
 
 		 1098 aa  76.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  25.36 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.22 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  26.5 
 
 		 616 aa  75.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1270 aa  74.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  30.38 
 
 		 645 aa  73.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  22.22 
 
 		 1203 aa  72.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  31.01 
 
 		 1019 aa  72  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  25.09 
 
 		 1107 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1289 aa  69.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.37 
 
 		 3197 aa  68.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.53 
 
 		 1040 aa  67.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  29.05 
 
 		 1161 aa  65.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.29 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.16 
 
 		 891 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  24.38 
 
 		 1124 aa  63.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  21.81 
 
 		 1166 aa  63.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.44 
 
 		 3197 aa  63.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.14 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  28.74 
 
 		 1490 aa  62  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  29.34 
 
 		 4379 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.06 
 
 		 604 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.08 
 
 		 1138 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  27.12 
 
 		 657 aa  61.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.39 
 
 		 1340 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.56 
 
 		 1557 aa  59.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  25.48 
 
 		 646 aa  60.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  25.05 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  28.74 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  24.62 
 
 		 1126 aa  58.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  23.76 
 
 		 521 aa  57.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.78 
 
 		 2807 aa  57.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.34 
 
 		 447 aa  57  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  23.93 
 
 		 437 aa  57  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.51 
 
 		 472 aa  56.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.97 
 
 		 1113 aa  56.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.48 
 
 		 566 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>