50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0847 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 
482 aa  941    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.54 
 
 
453 aa  347  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.97 
 
 
455 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.38 
 
 
596 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  24.62 
 
 
556 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.69 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.54 
 
 
546 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.56 
 
 
585 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  29.34 
 
 
593 aa  63.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.34 
 
 
577 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.38 
 
 
655 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  28.31 
 
 
573 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  43.66 
 
 
1208 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  29.93 
 
 
1183 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.21 
 
 
551 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  29 
 
 
878 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.78 
 
 
1226 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  28.81 
 
 
1129 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  32.62 
 
 
1203 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  25.52 
 
 
593 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.27 
 
 
1193 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.33 
 
 
1114 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  28.57 
 
 
645 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.62 
 
 
1170 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  39.74 
 
 
1192 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.46 
 
 
1225 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  28.04 
 
 
646 aa  53.9  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.29 
 
 
1040 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  29.78 
 
 
492 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.41 
 
 
1066 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.46 
 
 
526 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.47 
 
 
600 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  24.05 
 
 
649 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.02 
 
 
585 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.8 
 
 
1228 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.78 
 
 
574 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  31.38 
 
 
752 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.93 
 
 
737 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.53 
 
 
1236 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  31.11 
 
 
562 aa  46.6  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  24.23 
 
 
1098 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.33 
 
 
1189 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  30.28 
 
 
1109 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  31.45 
 
 
566 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  29.87 
 
 
1575 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  23.12 
 
 
499 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
1138 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  32.43 
 
 
1107 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.59 
 
 
8871 aa  43.5  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.26 
 
 
1246 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>