92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2356 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 455 aa  909    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  87.64 
 
 		 453 aa  810    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  46.97 
 
 		 482 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  29.05 
 
 		 556 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.27 
 
 		 593 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  29.25 
 
 		 573 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.53 
 
 		 569 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.33 
 
 		 596 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  27.46 
 
 		 593 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.44 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.59 
 
 		 546 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.3 
 
 		 600 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  24.73 
 
 		 649 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  26.32 
 
 		 604 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  25.12 
 
 		 655 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  24.55 
 
 		 585 aa  84  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.97 
 
 		 574 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.29 
 
 		 1129 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  30.11 
 
 		 878 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  29.86 
 
 		 645 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.07 
 
 		 604 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.1 
 
 		 577 aa  73.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  28.71 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.5 
 
 		 583 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.17 
 
 		 1114 aa  70.1  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.73 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.42 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  23.92 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  23.9 
 
 		 1109 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1184 aa  66.6  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  30.2 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1127 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  23.55 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  26.28 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.27 
 
 		 1203 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  23.15 
 
 		 1088 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.97 
 
 		 1226 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29 
 
 		 1170 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.74 
 
 		 1126 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1575 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.57 
 
 		 1246 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  31.06 
 
 		 1183 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 585 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.26 
 
 		 1208 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.05 
 
 		 1189 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.11 
 
 		 1236 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  25.63 
 
 		 1098 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.54 
 
 		 737 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.77 
 
 		 1225 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  26.84 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.96 
 
 		 1228 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  22.84 
 
 		 803 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.37 
 
 		 1193 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  28.4 
 
 		 1208 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 1192 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.06 
 
 		 1126 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.25 
 
 		 1066 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.08 
 
 		 1120 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  26.19 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  31.58 
 
 		 1019 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1289 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  29.3 
 
 		 752 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.19 
 
 		 1040 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  31.3 
 
 		 1113 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  29.7 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  28.57 
 
 		 1166 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.28 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  23.51 
 
 		 691 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.84 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.43 
 
 		 8871 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 1138 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.24 
 
 		 655 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  23.3 
 
 		 1098 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.32 
 
 		 828 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.56 
 
 		 3197 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.84 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.99 
 
 		 974 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  24.32 
 
 		 1490 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.77 
 
 		 872 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.76 
 
 		 526 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  32.53 
 
 		 1133 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  33.67 
 
 		 1275 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  30.54 
 
 		 521 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  27.59 
 
 		 1107 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.87 
 
 		 1838 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3715  FG-GAP repeat-containing protein  24.07 
 
 		 514 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  28.66 
 
 		 912 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2753  FG-GAP repeat-containing protein  32.22 
 
 		 797 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.86 
 
 		 1127 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  26.58 
 
 		 3197 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  33.04 
 
 		 655 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  27.22 
 
 		 3041 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>