71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2651 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2651  ATPase  100 
 
 
752 aa  1549    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  45.03 
 
 
645 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  27.97 
 
 
646 aa  230  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  27.06 
 
 
664 aa  210  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  25.19 
 
 
878 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.9 
 
 
1127 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.39 
 
 
499 aa  63.9  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  32.99 
 
 
521 aa  63.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.53 
 
 
803 aa  61.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.24 
 
 
1114 aa  61.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.91 
 
 
1575 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  37.59 
 
 
1161 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.07 
 
 
737 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  27.65 
 
 
577 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.86 
 
 
600 aa  59.3  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.74 
 
 
1113 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.6 
 
 
455 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  30.05 
 
 
554 aa  57.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.38 
 
 
585 aa  57.4  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  28.49 
 
 
1109 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  31.17 
 
 
813 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.94 
 
 
1236 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.97 
 
 
1088 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.78 
 
 
1189 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  31.38 
 
 
482 aa  54.7  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26 
 
 
1226 aa  54.3  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  25.2 
 
 
1098 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.95 
 
 
526 aa  53.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.03 
 
 
604 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.38 
 
 
574 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.77 
 
 
1246 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  28.79 
 
 
1126 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  26.44 
 
 
562 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  28.03 
 
 
1098 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.77 
 
 
1208 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.24 
 
 
2807 aa  51.2  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.94 
 
 
891 aa  51.2  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.15 
 
 
1490 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.67 
 
 
546 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  26.41 
 
 
566 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  34.48 
 
 
1166 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.27 
 
 
566 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  23.55 
 
 
649 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.47 
 
 
1040 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.35 
 
 
1208 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28.35 
 
 
1289 aa  49.3  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.73 
 
 
453 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.56 
 
 
1225 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  26.41 
 
 
604 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.43 
 
 
1019 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.58 
 
 
1129 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.91 
 
 
585 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.02 
 
 
1557 aa  47.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.92 
 
 
1838 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.66 
 
 
1170 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.46 
 
 
974 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
1127 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.4 
 
 
1126 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  29.7 
 
 
681 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  26.07 
 
 
3197 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  31.5 
 
 
604 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.71 
 
 
551 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  33.91 
 
 
655 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.59 
 
 
472 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.85 
 
 
1228 aa  45.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  26.49 
 
 
583 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  28.57 
 
 
685 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.01 
 
 
596 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.01 
 
 
655 aa  44.3  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  28.57 
 
 
685 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.36 
 
 
655 aa  44.3  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>