More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1618 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 1133 aa  2311    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 1184 aa  475  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1127 aa  376  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1104 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.74 
 
 		 1138 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.38 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.06 
 
 		 1193 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  24.9 
 
 		 577 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.91 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1289 aa  71.6  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.73 
 
 		 803 aa  71.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  25.86 
 
 		 1113 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  30.45 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  25.95 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 878 aa  68.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.8 
 
 		 810 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 906 aa  67.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  22.85 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.69 
 
 		 1098 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  27.72 
 
 		 1183 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.3 
 
 		 1979 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 465 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.81 
 
 		 1114 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  27.06 
 
 		 562 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.93 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 1069 aa  62.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.17 
 
 		 1246 aa  61.6  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.75 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.06 
 
 		 604 aa  61.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.93 
 
 		 466 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.06 
 
 		 596 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  30.57 
 
 		 864 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.03 
 
 		 465 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.12 
 
 		 1192 aa  60.1  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  36.78 
 
 		 492 aa  60.1  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 740 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  30.22 
 
 		 661 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1276 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 4079 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.53 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  28.39 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.15 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 3560 aa  58.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.41 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  22.59 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 942 aa  58.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.21 
 
 		 1226 aa  58.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.78 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 402 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.03 
 
 		 397 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.13 
 
 		 1228 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 3035 aa  57.4  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  22.9 
 
 		 593 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1406 aa  57  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.18 
 
 		 681 aa  56.6  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 		 586 aa  57  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 592 aa  57.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  30.89 
 
 		 1120 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  24.18 
 
 		 649 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  31.06 
 
 		 593 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  34.29 
 
 		 1166 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 762 aa  56.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 374 aa  56.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 713 aa  56.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.57 
 
 		 1126 aa  56.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 927 aa  55.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  30.38 
 
 		 521 aa  55.5  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.6 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 435 aa  55.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 465 aa  55.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.15 
 
 		 1225 aa  55.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 543 aa  54.7  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 311 aa  54.7  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.7 
 
 		 208 aa  55.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.09 
 
 		 600 aa  54.3  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 639 aa  54.3  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 589 aa  54.3  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  25.93 
 
 		 685 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 1236 aa  54.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.82 
 
 		 574 aa  54.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 		 988 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 615 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  25.93 
 
 		 685 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 376 aa  54.3  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.06 
 
 		 1694 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 362 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 596 aa  53.5  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0333  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 204 aa  53.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000188305  normal  0.0509123 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0120  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 555 aa  53.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 4489 aa  53.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 226 aa  53.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.65 
 
 		 632 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  33.01 
 
 		 635 aa  53.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.31 
 
 		 384 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 611 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.2 
 
 		 737 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 		 222 aa  53.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>