More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2954 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1104 aa  2224    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
1127 aa  357  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
1184 aa  244  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  25.77 
 
 
1133 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 
1138 aa  231  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.67 
 
 
569 aa  81.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  24.19 
 
 
556 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
878 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.99 
 
 
620 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  25.13 
 
 
573 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.56 
 
 
810 aa  74.7  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.11 
 
 
593 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.55 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
265 aa  72.4  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
637 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
620 aa  71.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.97 
 
 
725 aa  71.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.55 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
748 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.83 
 
 
600 aa  69.7  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
615 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  23.41 
 
 
604 aa  68.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.88 
 
 
803 aa  68.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  25.55 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.92 
 
 
614 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.92 
 
 
626 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.92 
 
 
614 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
614 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
636 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.21 
 
 
626 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.04 
 
 
626 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
614 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
614 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
639 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
612 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
827 aa  66.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
377 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.38 
 
 
267 aa  65.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.38 
 
 
436 aa  66.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
611 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 
266 aa  65.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
374 aa  63.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
635 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0915  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
324 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
635 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
4079 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 
689 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
313 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
566 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
1106 aa  63.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 
344 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 
289 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 
344 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  28.1 
 
 
336 aa  62.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
589 aa  62.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.2 
 
 
733 aa  62.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
3145 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
522 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
289 aa  62.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
399 aa  62.4  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
522 aa  61.6  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
1737 aa  61.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
502 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.39 
 
 
306 aa  61.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.46 
 
 
1106 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
739 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.3 
 
 
546 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.35 
 
 
816 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.83 
 
 
875 aa  60.1  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.16 
 
 
1154 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
405 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
927 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.3 
 
 
964 aa  59.3  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  29.23 
 
 
282 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 
358 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
1421 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
573 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
754 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
465 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
909 aa  58.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.46 
 
 
1138 aa  58.9  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.01 
 
 
503 aa  58.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.22 
 
 
1040 aa  58.5  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 
2240 aa  58.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 
572 aa  58.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
646 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 
265 aa  58.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
754 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
364 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
313 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
573 aa  57.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
955 aa  57.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
3301 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
681 aa  57.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 
632 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
750 aa  56.6  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
226 aa  56.6  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 
219 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
3172 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
808 aa  56.6  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>