More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2945 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1184 aa  2380    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  32.39 
 
 		 1133 aa  442  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 1127 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 1138 aa  251  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1104 aa  222  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.78 
 
 		 562 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  29.25 
 
 		 573 aa  111  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.94 
 
 		 556 aa  107  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  28.51 
 
 		 577 aa  105  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  29.06 
 
 		 604 aa  105  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.9 
 
 		 649 aa  105  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.18 
 
 		 546 aa  104  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.39 
 
 		 569 aa  101  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.77 
 
 		 551 aa  90.1  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  35.27 
 
 		 593 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.51 
 
 		 596 aa  84.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.42 
 
 		 803 aa  81.6  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  24.35 
 
 		 593 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.05 
 
 		 600 aa  80.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1575 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.35 
 
 		 585 aa  77  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  26.37 
 
 		 604 aa  76.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.82 
 
 		 1193 aa  72.4  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.48 
 
 		 453 aa  72  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.93 
 
 		 574 aa  71.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.9 
 
 		 1225 aa  70.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  32.58 
 
 		 499 aa  70.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29.87 
 
 		 1126 aa  68.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  29.63 
 
 		 574 aa  67.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  26.1 
 
 		 583 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.57 
 
 		 469 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.68 
 
 		 1236 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.42 
 
 		 1192 aa  65.1  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.65 
 
 		 1557 aa  65.1  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.5 
 
 		 1114 aa  65.1  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.62 
 
 		 1246 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.78 
 
 		 1208 aa  63.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  29.86 
 
 		 974 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.39 
 
 		 3197 aa  63.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.15 
 
 		 1189 aa  62.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.99 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.03 
 
 		 1225 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.54 
 
 		 1226 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  29.62 
 
 		 1088 aa  62.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  30.94 
 
 		 691 aa  62.4  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.82 
 
 		 465 aa  62  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 878 aa  62  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 740 aa  62  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.88 
 
 		 1228 aa  61.6  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30 
 
 		 462 aa  61.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  27.6 
 
 		 1126 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 217 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  27.08 
 
 		 655 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.69 
 
 		 465 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  26.3 
 
 		 4379 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29.44 
 
 		 1490 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  29.25 
 
 		 1275 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.09 
 
 		 1113 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  39.39 
 
 		 1170 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.42 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.48 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 3172 aa  59.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 3301 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1289 aa  58.2  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.1 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.49 
 
 		 455 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.92 
 
 		 1838 aa  57.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 620 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  36.43 
 
 		 1098 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.52 
 
 		 1109 aa  57.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  29.63 
 
 		 1129 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  26.92 
 
 		 1183 aa  57.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.35 
 
 		 810 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 632 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.14 
 
 		 314 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  27.46 
 
 		 681 aa  56.2  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.86 
 
 		 1222 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.62 
 
 		 1340 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  55.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 527 aa  55.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 927 aa  55.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 249 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.98 
 
 		 889 aa  55.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 249 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  24.16 
 
 		 585 aa  55.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  31.78 
 
 		 616 aa  54.7  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 362 aa  54.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 		 1979 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 4079 aa  54.3  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 873 aa  54.3  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1121 aa  54.3  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  28.04 
 
 		 685 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 		 436 aa  54.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 565 aa  54.3  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  24.66 
 
 		 1113 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>