84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2002 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  981    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  50 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.64 
 
 		 526 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.92 
 
 		 649 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  25.84 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  24.67 
 
 		 593 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  27.08 
 
 		 573 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.17 
 
 		 1129 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.51 
 
 		 546 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.7 
 
 		 1114 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  26.1 
 
 		 577 aa  90.1  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  28.26 
 
 		 1120 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.37 
 
 		 593 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.53 
 
 		 600 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  25.42 
 
 		 604 aa  87  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.95 
 
 		 574 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.04 
 
 		 583 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  24.39 
 
 		 1088 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  24.19 
 
 		 1109 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  36.05 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.29 
 
 		 604 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.39 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.66 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.09 
 
 		 638 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.69 
 
 		 1170 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  27.15 
 
 		 1098 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  29.89 
 
 		 655 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  24.05 
 
 		 1126 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.28 
 
 		 1066 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23.82 
 
 		 1183 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.52 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.22 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.27 
 
 		 803 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  25.13 
 
 		 658 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  22.89 
 
 		 1107 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.66 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.58 
 
 		 1040 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.78 
 
 		 1246 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  26.79 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.24 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.14 
 
 		 1189 aa  67.8  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.49 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.55 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  23.99 
 
 		 1098 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.76 
 
 		 1228 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 1226 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  27.66 
 
 		 1208 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.97 
 
 		 1193 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.51 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.68 
 
 		 655 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  24.77 
 
 		 1113 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.34 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  22.87 
 
 		 1166 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.68 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  29.78 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  33.57 
 
 		 1172 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.15 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.81 
 
 		 1192 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.28 
 
 		 1225 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  30.85 
 
 		 1127 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.42 
 
 		 1208 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.16 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  29.73 
 
 		 646 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24 
 
 		 737 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  31.53 
 
 		 616 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  32.28 
 
 		 1161 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.81 
 
 		 1236 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  33.58 
 
 		 574 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1575 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  24.47 
 
 		 667 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  26.38 
 
 		 645 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.95 
 
 		 585 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 1184 aa  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  25.65 
 
 		 657 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  41.03 
 
 		 691 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  25.34 
 
 		 878 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.75 
 
 		 1490 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  31.93 
 
 		 951 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  27.08 
 
 		 730 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1127 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.95 
 
 		 1203 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  23.45 
 
 		 620 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1133 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  30.59 
 
 		 664 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>