109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2932 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 
574 aa  1158    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  57.12 
 
 
546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.81 
 
 
551 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.84 
 
 
596 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  39.23 
 
 
593 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  36.84 
 
 
556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  37.67 
 
 
583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  37.25 
 
 
569 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  35.02 
 
 
593 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.05 
 
 
600 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  37.43 
 
 
649 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  35.3 
 
 
604 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  37.6 
 
 
562 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  36.95 
 
 
604 aa  256  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  35.09 
 
 
577 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  35.07 
 
 
574 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  34.21 
 
 
573 aa  240  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  34.33 
 
 
803 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.43 
 
 
585 aa  170  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.63 
 
 
1170 aa  163  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.35 
 
 
1246 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.8 
 
 
1192 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.14 
 
 
1208 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.6 
 
 
1228 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.37 
 
 
1225 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.72 
 
 
1236 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  25.95 
 
 
1183 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
1127 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.43 
 
 
1193 aa  143  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.76 
 
 
1575 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.66 
 
 
1098 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.58 
 
 
1127 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.71 
 
 
737 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.8 
 
 
1114 aa  136  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.34 
 
 
1113 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.53 
 
 
1226 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.49 
 
 
1189 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  26.94 
 
 
1172 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  26.31 
 
 
1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.21 
 
 
1066 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.5 
 
 
1088 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.12 
 
 
554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  24.26 
 
 
1208 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.86 
 
 
585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.59 
 
 
1129 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.74 
 
 
1203 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  28.65 
 
 
691 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.01 
 
 
526 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  25.59 
 
 
1098 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.04 
 
 
1109 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  27.94 
 
 
521 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.74 
 
 
951 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  29.3 
 
 
1126 aa  97.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  24.74 
 
 
1166 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.76 
 
 
492 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  25.08 
 
 
1107 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  30.09 
 
 
499 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.75 
 
 
566 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.03 
 
 
453 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  34.74 
 
 
878 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  25.81 
 
 
685 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  25.81 
 
 
685 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  22.02 
 
 
655 aa  80.9  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.09 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.97 
 
 
573 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  22.33 
 
 
681 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  23.29 
 
 
645 aa  70.1  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  26.33 
 
 
1124 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
1184 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.66 
 
 
1161 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  25.05 
 
 
566 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  24.75 
 
 
655 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  24.41 
 
 
646 aa  60.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.72 
 
 
1838 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.2 
 
 
2194 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.62 
 
 
655 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.8 
 
 
645 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  28.98 
 
 
664 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.29 
 
 
2807 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.12 
 
 
638 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  25.06 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.54 
 
 
8871 aa  54.7  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  28.16 
 
 
1490 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  24.27 
 
 
590 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  24.37 
 
 
1126 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.57 
 
 
1040 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  24.55 
 
 
658 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.51 
 
 
616 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  24.76 
 
 
3197 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.33 
 
 
1113 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  25.59 
 
 
482 aa  50.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.16 
 
 
1275 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.07 
 
 
959 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  28.96 
 
 
730 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.17 
 
 
1118 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.92 
 
 
1340 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  25.2 
 
 
435 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  24.86 
 
 
752 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.36 
 
 
1222 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  24.82 
 
 
872 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>