91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3123 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  87.64 
 
 		 455 aa  766    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 453 aa  906    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  46.54 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.27 
 
 		 593 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.89 
 
 		 556 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.77 
 
 		 596 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  32.23 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  25.7 
 
 		 593 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.51 
 
 		 569 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.47 
 
 		 600 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.62 
 
 		 546 aa  97.1  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  25 
 
 		 649 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.35 
 
 		 551 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  28.08 
 
 		 655 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  26.79 
 
 		 604 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  23.84 
 
 		 1129 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.72 
 
 		 574 aa  83.2  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  32.26 
 
 		 878 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.44 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  28.77 
 
 		 583 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.18 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  25.99 
 
 		 604 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25 
 
 		 585 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  24.5 
 
 		 1109 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.43 
 
 		 585 aa  70.1  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  27.14 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  28 
 
 		 646 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  22.72 
 
 		 1183 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.7 
 
 		 1114 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  23.66 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1184 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.1 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1575 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  26.7 
 
 		 1098 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.41 
 
 		 1126 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  23.55 
 
 		 1088 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.26 
 
 		 737 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.29 
 
 		 1228 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1127 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.92 
 
 		 1170 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  23.92 
 
 		 1127 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  28.12 
 
 		 1208 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.68 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.1 
 
 		 1236 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.6 
 
 		 1203 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  30.6 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.21 
 
 		 1246 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  30.65 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.48 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.25 
 
 		 1066 aa  57.4  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  26.74 
 
 		 1120 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.85 
 
 		 1192 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  22.96 
 
 		 803 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.63 
 
 		 1193 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.31 
 
 		 1208 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  28.35 
 
 		 1166 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.97 
 
 		 1225 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.44 
 
 		 1138 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  23.36 
 
 		 1838 aa  53.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.68 
 
 		 8871 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.35 
 
 		 657 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1289 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  25.93 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.98 
 
 		 1040 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  27.29 
 
 		 521 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.09 
 
 		 1189 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  30.43 
 
 		 1113 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  24.64 
 
 		 691 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  28.72 
 
 		 655 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.98 
 
 		 1226 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.19 
 
 		 677 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.57 
 
 		 681 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3715  FG-GAP repeat-containing protein  23.61 
 
 		 514 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  25.59 
 
 		 1275 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  29.89 
 
 		 1107 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  25.53 
 
 		 1126 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  27.68 
 
 		 828 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.84 
 
 		 655 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.51 
 
 		 1161 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.16 
 
 		 573 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.27 
 
 		 616 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  30.53 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.78 
 
 		 1172 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16659  predicted protein  30.77 
 
 		 742 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1133 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  24.02 
 
 		 1490 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  25.54 
 
 		 668 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  30.28 
 
 		 760 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  31.45 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  26.63 
 
 		 752 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.49 
 
 		 959 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>