112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2942 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 
546 aa  1094    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  55.03 
 
 
574 aa  566  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.53 
 
 
596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.15 
 
 
551 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  40.29 
 
 
593 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  40.99 
 
 
569 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  39.44 
 
 
583 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  37.86 
 
 
556 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  36.9 
 
 
593 aa  309  8e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  38.82 
 
 
604 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  36.18 
 
 
649 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  37.27 
 
 
562 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.93 
 
 
600 aa  276  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  36.14 
 
 
573 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  34.4 
 
 
577 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  37.36 
 
 
604 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  35.69 
 
 
574 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.58 
 
 
585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  33.63 
 
 
803 aa  183  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.5 
 
 
1246 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.25 
 
 
1170 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.01 
 
 
1193 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.89 
 
 
1225 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  30.96 
 
 
1098 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  28.79 
 
 
1203 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  27.05 
 
 
1183 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.02 
 
 
1208 aa  157  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.13 
 
 
1120 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.34 
 
 
1236 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.12 
 
 
1192 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.04 
 
 
1114 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.59 
 
 
1228 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  26.37 
 
 
1208 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.47 
 
 
1088 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  28.07 
 
 
1113 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  31 
 
 
1575 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.65 
 
 
1189 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.33 
 
 
1129 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.52 
 
 
1226 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.03 
 
 
737 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.04 
 
 
1109 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1127 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.29 
 
 
1066 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.47 
 
 
1127 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.4 
 
 
951 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  28.91 
 
 
691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  26.08 
 
 
1107 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.05 
 
 
1166 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  27.46 
 
 
1098 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  26.92 
 
 
1172 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.7 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  29.81 
 
 
1126 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.76 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  27.11 
 
 
521 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  25.35 
 
 
655 aa  97.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.17 
 
 
1161 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.62 
 
 
453 aa  97.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  26.24 
 
 
566 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
1184 aa  93.6  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  35.52 
 
 
878 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.66 
 
 
492 aa  89.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.66 
 
 
455 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  28.83 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.37 
 
 
526 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  25.1 
 
 
685 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  25.1 
 
 
685 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.2 
 
 
573 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.76 
 
 
1838 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  25.12 
 
 
681 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  28.38 
 
 
730 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  25.32 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  25.54 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.05 
 
 
2807 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.91 
 
 
658 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.24 
 
 
566 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.25 
 
 
8871 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  34.59 
 
 
1133 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  27.53 
 
 
646 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29.67 
 
 
1490 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.2 
 
 
655 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  24.96 
 
 
655 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.35 
 
 
2194 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  27.5 
 
 
645 aa  57  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.74 
 
 
657 aa  57  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.33 
 
 
1275 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  25.55 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.31 
 
 
1124 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.24 
 
 
872 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29.38 
 
 
1019 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.94 
 
 
645 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.03 
 
 
1126 aa  50.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  26.67 
 
 
664 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.25 
 
 
1040 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  25.5 
 
 
685 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.27 
 
 
3197 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.43 
 
 
1138 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  29.67 
 
 
752 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.55 
 
 
959 aa  48.9  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.85 
 
 
11716 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.64 
 
 
889 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>