119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0920 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  100 
 
 
604 aa  1233    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  54.47 
 
 
583 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  45.52 
 
 
556 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  44.18 
 
 
593 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  45.96 
 
 
649 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  44.34 
 
 
573 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  39.69 
 
 
569 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  40.78 
 
 
562 aa  363  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.76 
 
 
551 aa  354  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.22 
 
 
600 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  38.28 
 
 
577 aa  343  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  38.34 
 
 
593 aa  342  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.82 
 
 
546 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.68 
 
 
596 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  35.11 
 
 
574 aa  277  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.3 
 
 
574 aa  267  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  33.76 
 
 
604 aa  250  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.64 
 
 
1193 aa  207  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.13 
 
 
585 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.62 
 
 
1192 aa  194  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  30.83 
 
 
803 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.07 
 
 
1208 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.18 
 
 
1246 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.49 
 
 
1098 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.15 
 
 
1170 aa  181  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.48 
 
 
1225 aa  180  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  28.62 
 
 
1129 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.57 
 
 
1236 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.08 
 
 
1189 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.69 
 
 
737 aa  172  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  28.92 
 
 
1183 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.79 
 
 
1228 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  32.78 
 
 
1575 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1127 aa  164  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.55 
 
 
1226 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.59 
 
 
1066 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  29.26 
 
 
1109 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.69 
 
 
1127 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.72 
 
 
1088 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.99 
 
 
1208 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.84 
 
 
1120 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.62 
 
 
1114 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.56 
 
 
1113 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  28.21 
 
 
951 aa  143  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  27.99 
 
 
1126 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.29 
 
 
1166 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.92 
 
 
1098 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.65 
 
 
1172 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  28.67 
 
 
691 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.74 
 
 
1161 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  27.56 
 
 
1107 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.74 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  24.36 
 
 
1203 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.27 
 
 
554 aa  104  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.99 
 
 
657 aa  100  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.42 
 
 
681 aa  99.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.64 
 
 
453 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.19 
 
 
655 aa  97.4  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.14 
 
 
655 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  25.56 
 
 
668 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  28.9 
 
 
499 aa  90.9  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  23.16 
 
 
655 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.78 
 
 
521 aa  88.6  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.8 
 
 
1040 aa  88.2  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
1184 aa  87.4  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.24 
 
 
658 aa  87.8  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  26 
 
 
492 aa  87  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  21.3 
 
 
685 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.99 
 
 
638 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  21.46 
 
 
685 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.64 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  27.5 
 
 
566 aa  81.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.51 
 
 
677 aa  78.2  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  25.97 
 
 
730 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  21.63 
 
 
667 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.62 
 
 
645 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.35 
 
 
1275 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  29.65 
 
 
878 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.32 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.83 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.91 
 
 
1838 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  29.1 
 
 
1124 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  30.92 
 
 
646 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  24.91 
 
 
590 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  25 
 
 
645 aa  57.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.36 
 
 
1019 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.07 
 
 
604 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.2 
 
 
891 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  24.47 
 
 
1126 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  23.84 
 
 
872 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  23.18 
 
 
657 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.36 
 
 
573 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.55 
 
 
1490 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  24.38 
 
 
482 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  26.34 
 
 
3197 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 
1104 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.85 
 
 
1222 aa  50.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  23.33 
 
 
620 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.74 
 
 
1113 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>