130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1684 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  100 
 
 
573 aa  1180    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  55.79 
 
 
562 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  47.45 
 
 
577 aa  497  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  43.68 
 
 
574 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  44.34 
 
 
604 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  40.91 
 
 
556 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  41.65 
 
 
569 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.66 
 
 
600 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  42.64 
 
 
583 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  39.42 
 
 
649 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  39.39 
 
 
593 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  38.36 
 
 
593 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.86 
 
 
596 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.08 
 
 
551 aa  299  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.02 
 
 
546 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  36.35 
 
 
604 aa  266  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.77 
 
 
585 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.09 
 
 
574 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  30.65 
 
 
1120 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  31.21 
 
 
1098 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  31.95 
 
 
1127 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  29.39 
 
 
1129 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  29.23 
 
 
1183 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.03 
 
 
1189 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  27.45 
 
 
1208 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.45 
 
 
1208 aa  163  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  30.67 
 
 
803 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.07 
 
 
737 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.85 
 
 
1193 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.73 
 
 
1236 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.97 
 
 
1246 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
1127 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.62 
 
 
1228 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  26.68 
 
 
1088 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  29.48 
 
 
1107 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  27.75 
 
 
1109 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  30.03 
 
 
1172 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  26.94 
 
 
1113 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.98 
 
 
1161 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.38 
 
 
1114 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.98 
 
 
1170 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  28.79 
 
 
1166 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.04 
 
 
1192 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  28.62 
 
 
585 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  28.16 
 
 
1098 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  27.63 
 
 
1126 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.08 
 
 
1226 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.38 
 
 
1203 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.03 
 
 
1066 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.82 
 
 
951 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
1184 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.25 
 
 
1225 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.26 
 
 
691 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.41 
 
 
453 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.75 
 
 
1575 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.08 
 
 
492 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.98 
 
 
455 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.96 
 
 
1040 aa  99  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.13 
 
 
521 aa  94.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  36.14 
 
 
878 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.48 
 
 
499 aa  93.6  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.33 
 
 
526 aa  91.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  27.07 
 
 
566 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  25.73 
 
 
655 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.15 
 
 
554 aa  89.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.14 
 
 
566 aa  87  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  26.67 
 
 
730 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.21 
 
 
1019 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.88 
 
 
573 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  22.3 
 
 
681 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.72 
 
 
668 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.14 
 
 
645 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  22.33 
 
 
667 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  27.78 
 
 
645 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.65 
 
 
638 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.3 
 
 
655 aa  64.7  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  43 
 
 
646 aa  63.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  30.05 
 
 
1124 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.85 
 
 
974 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.12 
 
 
657 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  28.83 
 
 
482 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
1104 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  22.5 
 
 
685 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  22.67 
 
 
685 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  23.4 
 
 
590 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.82 
 
 
604 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.71 
 
 
655 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.97 
 
 
1113 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.42 
 
 
872 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.38 
 
 
658 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.57 
 
 
1838 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  22.65 
 
 
657 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  24.85 
 
 
472 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.81 
 
 
1222 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  27 
 
 
1557 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.57 
 
 
469 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  23.31 
 
 
813 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  23.01 
 
 
1490 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.22 
 
 
2807 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  23.54 
 
 
620 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>