107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3980 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  35.78 
 
 		 1208 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  38.01 
 
 		 1107 aa  638    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  43.22 
 
 		 1127 aa  840    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  36.65 
 
 		 1183 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  51.16 
 
 		 1098 aa  1028    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  43.62 
 
 		 1109 aa  844    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  38.82 
 
 		 1098 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  40.74 
 
 		 1120 aa  713    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  43.65 
 
 		 1172 aa  832    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  44.25 
 
 		 1088 aa  882    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  42.69 
 
 		 1129 aa  817    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1126 aa  2309    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  40.17 
 
 		 1113 aa  720    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  39.64 
 
 		 1166 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  38.33 
 
 		 1161 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  36.57 
 
 		 1203 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.36 
 
 		 1114 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.19 
 
 		 1228 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.06 
 
 		 1246 aa  462  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.9 
 
 		 1193 aa  459  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.88 
 
 		 1208 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.73 
 
 		 1170 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.49 
 
 		 1236 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.05 
 
 		 1226 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.14 
 
 		 1192 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.13 
 
 		 1225 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.9 
 
 		 1189 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.34 
 
 		 596 aa  168  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.99 
 
 		 604 aa  154  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.27 
 
 		 649 aa  152  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.59 
 
 		 593 aa  152  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  26.93 
 
 		 593 aa  151  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  27.63 
 
 		 573 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.56 
 
 		 556 aa  148  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  26.07 
 
 		 583 aa  144  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.33 
 
 		 600 aa  144  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.21 
 
 		 569 aa  137  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.74 
 
 		 585 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.83 
 
 		 1066 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  38.79 
 
 		 604 aa  127  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.87 
 
 		 577 aa  125  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.87 
 
 		 546 aa  124  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.23 
 
 		 551 aa  115  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.31 
 
 		 566 aa  105  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.1 
 
 		 803 aa  97.8  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  30.82 
 
 		 574 aa  97.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.39 
 
 		 574 aa  94.7  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.05 
 
 		 492 aa  94.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  24.54 
 
 		 951 aa  94.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.7 
 
 		 573 aa  91.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 1127 aa  89.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.48 
 
 		 554 aa  89.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.53 
 
 		 562 aa  88.6  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.93 
 
 		 737 aa  85.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  25.91 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1575 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.02 
 
 		 1040 aa  76.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  29.43 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.45 
 
 		 585 aa  73.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  25.49 
 
 		 668 aa  68.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.29 
 
 		 655 aa  68.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  36.36 
 
 		 664 aa  63.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  30.85 
 
 		 604 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.53 
 
 		 453 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  23.83 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.88 
 
 		 1490 aa  57.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  22.32 
 
 		 730 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  28.52 
 
 		 878 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.52 
 
 		 1019 aa  55.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25 
 
 		 616 aa  55.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  26.03 
 
 		 437 aa  54.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  24.16 
 
 		 566 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.78 
 
 		 974 aa  53.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.45 
 
 		 657 aa  53.5  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 1184 aa  53.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  29.12 
 
 		 472 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.72 
 
 		 2807 aa  53.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26.51 
 
 		 691 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  28.95 
 
 		 3197 aa  52  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  24.6 
 
 		 438 aa  52  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  23.91 
 
 		 447 aa  51.6  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  29.34 
 
 		 1838 aa  51.6  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  23.92 
 
 		 404 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  45.33 
 
 		 526 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.14 
 
 		 3197 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  27.54 
 
 		 433 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  23.37 
 
 		 657 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  22.12 
 
 		 658 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  23.34 
 
 		 681 aa  50.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.54 
 
 		 655 aa  49.7  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.44 
 
 		 645 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  27.41 
 
 		 872 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.66 
 
 		 638 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  27.78 
 
 		 590 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  29.69 
 
 		 1557 aa  48.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  27.13 
 
 		 469 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  23.89 
 
 		 1126 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.47 
 
 		 455 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  24.56 
 
 		 554 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  22.22 
 
 		 685 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>