108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1540 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  100 
 
 		 404 aa  821    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  35.42 
 
 		 1022 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.49 
 
 		 1019 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  27.58 
 
 		 828 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1289 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.2 
 
 		 1557 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.06 
 
 		 1126 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  28.46 
 
 		 829 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  29.48 
 
 		 749 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  28.39 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.82 
 
 		 872 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  25.32 
 
 		 1437 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.16 
 
 		 604 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.75 
 
 		 621 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.21 
 
 		 2807 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  24.8 
 
 		 1838 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  26.88 
 
 		 1346 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  27.33 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  27.3 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.74 
 
 		 635 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  26.59 
 
 		 1129 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.07 
 
 		 1490 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.38 
 
 		 891 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.99 
 
 		 1118 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.8 
 
 		 3197 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.9 
 
 		 1337 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  24.53 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  30.11 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25.41 
 
 		 616 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  26.81 
 
 		 1976 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.18 
 
 		 974 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  24.4 
 
 		 813 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  26.23 
 
 		 469 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.85 
 
 		 889 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  29.48 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.02 
 
 		 3197 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  28.42 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30.16 
 
 		 657 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  24.37 
 
 		 1348 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  24.84 
 
 		 1109 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  23.88 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.57 
 
 		 1113 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  34.87 
 
 		 935 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  24.71 
 
 		 720 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  25.66 
 
 		 917 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 2032 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1825 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1825 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  25.77 
 
 		 2031 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  25.69 
 
 		 4379 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.82 
 
 		 1222 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 2031 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4255  FG-GAP repeat-containing protein  28.09 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000954182  hitchhiker  0.000000354896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  24.82 
 
 		 485 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4012  FG-GAP repeat protein  39.25 
 
 		 910 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.14 
 
 		 1009 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  26.79 
 
 		 521 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27 
 
 		 1806 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.31 
 
 		 1228 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1638 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 2031 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.26 
 
 		 1225 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.29 
 
 		 1114 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  27.34 
 
 		 1527 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  31.37 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  23.41 
 
 		 1126 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  23.36 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  26.53 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  30.62 
 
 		 752 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  22.89 
 
 		 2762 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  24.81 
 
 		 1124 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  27.87 
 
 		 895 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  26.27 
 
 		 1433 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.59 
 
 		 1088 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  26.56 
 
 		 524 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.63 
 
 		 1340 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 		 1154 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3715  FG-GAP repeat-containing protein  23.43 
 
 		 514 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  27.46 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  24.03 
 
 		 1172 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  29.57 
 
 		 494 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  30.08 
 
 		 523 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  29.38 
 
 		 470 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.01 
 
 		 2194 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.37 
 
 		 959 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3626  FG-GAP repeat-containing protein  22.63 
 
 		 511 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  27.69 
 
 		 539 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  24.84 
 
 		 590 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0707  FG-GAP repeat-containing protein  23.46 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109321  hitchhiker  0.0000143754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  30.71 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.84 
 
 		 691 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  29.21 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  22.66 
 
 		 1127 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  20.69 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  22.22 
 
 		 2513 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  24.34 
 
 		 811 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  25.19 
 
 		 658 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  25.68 
 
 		 2497 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.87 
 
 		 1275 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>