56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4177 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  61.3 
 
 		 524 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1061    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  35.9 
 
 		 521 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  35.5 
 
 		 506 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  34.91 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  31.11 
 
 		 523 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  34.28 
 
 		 438 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  30.17 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  30.21 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  30.42 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.14 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  27.44 
 
 		 437 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.23 
 
 		 1126 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32 
 
 		 891 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.95 
 
 		 1088 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  26.95 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.17 
 
 		 1019 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.02 
 
 		 974 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1127 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.64 
 
 		 1118 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  32.35 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.37 
 
 		 1009 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.1 
 
 		 872 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.74 
 
 		 1124 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  27.27 
 
 		 691 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.47 
 
 		 889 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.98 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.93 
 
 		 1275 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.94 
 
 		 604 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  28.11 
 
 		 494 aa  53.5  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  26.24 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.63 
 
 		 3197 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  24.41 
 
 		 828 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  23.86 
 
 		 1557 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  21.77 
 
 		 4379 aa  50.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.47 
 
 		 3197 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  24.91 
 
 		 1348 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.46 
 
 		 1490 aa  50.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.29 
 
 		 1222 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  24.89 
 
 		 590 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30.48 
 
 		 657 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25 
 
 		 616 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  24.91 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  35.2 
 
 		 685 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.92 
 
 		 1113 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.45 
 
 		 1838 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  26.29 
 
 		 1527 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.67 
 
 		 604 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  29.11 
 
 		 1129 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  28.57 
 
 		 1022 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  23.79 
 
 		 1337 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  24.48 
 
 		 663 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27 
 
 		 1340 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  30.71 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  27.15 
 
 		 917 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  26.64 
 
 		 1437 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>