70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3776 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.23 
 
 		 621 aa  677    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 635 aa  1306    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.76 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29.07 
 
 		 1126 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  25.37 
 
 		 1433 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  29.89 
 
 		 1838 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  28.06 
 
 		 1124 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.54 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  28.9 
 
 		 1348 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.82 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.45 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.73 
 
 		 1337 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.74 
 
 		 404 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.38 
 
 		 1127 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.69 
 
 		 604 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.92 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.1 
 
 		 974 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  26.05 
 
 		 1346 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.77 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.63 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  27.96 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  28.09 
 
 		 1490 aa  57  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  26.44 
 
 		 261 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 1282 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.55 
 
 		 262 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  23.51 
 
 		 2558 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.59 
 
 		 298 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.62 
 
 		 289 aa  54.3  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  27.66 
 
 		 288 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 		 258 aa  53.5  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  27.59 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  29.72 
 
 		 409 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26 
 
 		 280 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  28.8 
 
 		 872 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  25.89 
 
 		 657 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  23.02 
 
 		 270 aa  51.6  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.53 
 
 		 284 aa  51.2  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  30.11 
 
 		 2497 aa  51.2  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  24.1 
 
 		 1437 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  27.67 
 
 		 640 aa  50.8  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.41 
 
 		 256 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  28.12 
 
 		 749 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 261 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.56 
 
 		 891 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 		 3193 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  24.68 
 
 		 2413 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.47 
 
 		 11716 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.85 
 
 		 1275 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  24.71 
 
 		 917 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  26.5 
 
 		 921 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  29.47 
 
 		 539 aa  47.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  26.58 
 
 		 554 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  29.84 
 
 		 690 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 2448 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  27.76 
 
 		 2064 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  26.5 
 
 		 469 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  26.34 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  28.4 
 
 		 510 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  27.27 
 
 		 2554 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  23.65 
 
 		 302 aa  44.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  25.52 
 
 		 435 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  25.64 
 
 		 485 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1127 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.38 
 
 		 2807 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1289 aa  43.9  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.83 
 
 		 1019 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  28 
 
 		 885 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 		 869 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.3 
 
 		 2094 aa  43.9  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>