41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5796 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1083    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  57.8 
 
 		 506 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  51.58 
 
 		 510 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  53.26 
 
 		 523 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  37.9 
 
 		 524 aa  325  9e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  34.73 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.18 
 
 		 437 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  26.12 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  27.21 
 
 		 438 aa  120  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  26.69 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.56 
 
 		 1126 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  28.03 
 
 		 3197 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  26.97 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.08 
 
 		 3197 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  26.42 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  26.46 
 
 		 1088 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.2 
 
 		 1222 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  23.88 
 
 		 1348 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  27.6 
 
 		 469 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.26 
 
 		 472 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  24.73 
 
 		 1557 aa  50.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27 
 
 		 1113 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  29.25 
 
 		 813 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1127 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  26.52 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.32 
 
 		 1009 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  24.38 
 
 		 1019 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.51 
 
 		 1340 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  24.73 
 
 		 974 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.27 
 
 		 1225 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.04 
 
 		 1490 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.56 
 
 		 8871 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25 
 
 		 616 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  26.21 
 
 		 828 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  25.81 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.76 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.02 
 
 		 1236 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.77 
 
 		 803 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  38.46 
 
 		 1126 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  22.71 
 
 		 872 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.88 
 
 		 569 aa  43.5  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>