72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3038 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  100 
 
 
524 aa  1076    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  61.3 
 
 
517 aa  643    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  38.49 
 
 
521 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  36.71 
 
 
506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  34.57 
 
 
510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  32.55 
 
 
523 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  29.45 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  30.14 
 
 
438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  28.57 
 
 
433 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  28.57 
 
 
435 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.97 
 
 
1126 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  27.13 
 
 
872 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
1127 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  30.39 
 
 
437 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.95 
 
 
1019 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  26.4 
 
 
386 aa  60.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.42 
 
 
472 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.05 
 
 
2807 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.77 
 
 
828 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  25.53 
 
 
3197 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.02 
 
 
974 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  30.11 
 
 
4379 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  35.29 
 
 
412 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  28.08 
 
 
813 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  25.19 
 
 
1348 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.15 
 
 
1275 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.49 
 
 
1490 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.54 
 
 
891 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25 
 
 
1838 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  28.64 
 
 
604 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  26.46 
 
 
1088 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.53 
 
 
3197 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  25.64 
 
 
663 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  28.37 
 
 
577 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  24.84 
 
 
485 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  28.04 
 
 
1129 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.13 
 
 
1040 aa  50.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  32.26 
 
 
1124 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.54 
 
 
1009 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.75 
 
 
1193 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.2 
 
 
1222 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  25.22 
 
 
469 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  27.44 
 
 
1346 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.51 
 
 
566 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28 
 
 
1246 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.93 
 
 
889 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  26.56 
 
 
404 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.12 
 
 
2194 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.13 
 
 
1289 aa  47  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  29.13 
 
 
1022 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.58 
 
 
8871 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  26.58 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  29.08 
 
 
562 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.67 
 
 
737 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  24.82 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  26.42 
 
 
685 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.6 
 
 
1118 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.26 
 
 
1208 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.01 
 
 
1236 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  27.11 
 
 
645 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.84 
 
 
1340 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.67 
 
 
1228 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  22.37 
 
 
554 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  25.82 
 
 
1337 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  23.22 
 
 
749 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  29.2 
 
 
604 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.36 
 
 
803 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  30.5 
 
 
574 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.66 
 
 
1225 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.97 
 
 
556 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.08 
 
 
1113 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  27.67 
 
 
917 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>