More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7267 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 523 aa  1077    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  51.63 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  52.51 
 
 		 521 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  51.92 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  32.55 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  31.11 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  30.89 
 
 		 438 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  27.7 
 
 		 435 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  30.9 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.79 
 
 		 1126 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  46.97 
 
 		 128 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  47.89 
 
 		 122 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  47.89 
 
 		 122 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  45.45 
 
 		 119 aa  64.7  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  47.89 
 
 		 122 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  36.08 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  43.66 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  39.44 
 
 		 127 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 125 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  49.23 
 
 		 123 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  45.07 
 
 		 124 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 125 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  45.07 
 
 		 122 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 125 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1042  ribosomal protein L7/L12  46.97 
 
 		 124 aa  62  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  43.06 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  30.27 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  43.94 
 
 		 133 aa  62  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 121 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  32.76 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  39.44 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  41.89 
 
 		 119 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  43.66 
 
 		 122 aa  61.6  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  41.89 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  43.66 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.03 
 
 		 1340 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  39.44 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  39.44 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  37.8 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00694  50S ribosomal protein L7/L12  33.66 
 
 		 125 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  43.06 
 
 		 124 aa  60.1  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  43.94 
 
 		 128 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  43.66 
 
 		 126 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  42.42 
 
 		 126 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  43.66 
 
 		 123 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  43.06 
 
 		 124 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  39.39 
 
 		 123 aa  60.1  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  39.44 
 
 		 128 aa  59.7  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 129 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  45.07 
 
 		 123 aa  59.7  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.37 
 
 		 889 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  43.94 
 
 		 128 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  37.33 
 
 		 121 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  35.21 
 
 		 126 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  35.21 
 
 		 126 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 125 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1326  ribosomal protein L7/L12  48.48 
 
 		 126 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2867  50S ribosomal protein L7/L12  42.42 
 
 		 121 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.45 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 124 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  36.62 
 
 		 126 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  43.94 
 
 		 125 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.02 
 
 		 1118 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.84 
 
 		 1222 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 125 aa  59.3  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  40.91 
 
 		 125 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  42.42 
 
 		 125 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  43.94 
 
 		 123 aa  59.3  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  44.62 
 
 		 125 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  39.44 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  43.08 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  39.44 
 
 		 123 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3447  ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00096763  hitchhiker  0.00626302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0162  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 122 aa  58.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000100689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.49 
 
 		 974 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  49.23 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  40.85 
 
 		 120 aa  58.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  39.44 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  42.42 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  42.25 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  40.91 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  39.44 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  38.03 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  39.44 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  39.51 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0150  ribosomal protein L7/L12  38.03 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000840717  normal  0.0325702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>