71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1458 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 510 aa  1062    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  51.58 
 
 		 521 aa  498  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  48.61 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  51.92 
 
 		 523 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  34.91 
 
 		 517 aa  273  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  34.57 
 
 		 524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  33.46 
 
 		 437 aa  126  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  31.13 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  30.31 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  28.3 
 
 		 433 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.56 
 
 		 1113 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.49 
 
 		 1222 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29.5 
 
 		 1126 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  29.34 
 
 		 974 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.74 
 
 		 2194 aa  70.5  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.89 
 
 		 1118 aa  70.1  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.51 
 
 		 1340 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.45 
 
 		 1490 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.63 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.98 
 
 		 889 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  29.32 
 
 		 1275 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.32 
 
 		 1225 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  29.8 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.47 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.73 
 
 		 616 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.19 
 
 		 1838 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.38 
 
 		 3197 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.62 
 
 		 604 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  28.42 
 
 		 404 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1289 aa  53.9  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.79 
 
 		 2807 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  26.54 
 
 		 1172 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.14 
 
 		 828 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  29.41 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  32.31 
 
 		 1124 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.6 
 
 		 3197 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  28.19 
 
 		 664 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.21 
 
 		 1208 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  25.82 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  29.03 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  25.74 
 
 		 1527 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.8 
 
 		 1337 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.08 
 
 		 1246 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  26.04 
 
 		 1437 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  27.04 
 
 		 1029 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  28.57 
 
 		 720 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 1282 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.46 
 
 		 1009 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.64 
 
 		 1228 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.16 
 
 		 593 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  28.93 
 
 		 685 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  26.67 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  27.37 
 
 		 1348 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.18 
 
 		 794 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  26.43 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  27.31 
 
 		 1433 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.64 
 
 		 803 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.74 
 
 		 645 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  28.93 
 
 		 685 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  21.7 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 		 635 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  26.64 
 
 		 494 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.4 
 
 		 872 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.56 
 
 		 1129 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.51 
 
 		 1557 aa  44.3  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.57 
 
 		 1040 aa  44.3  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.97 
 
 		 1154 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  25.91 
 
 		 1346 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.78 
 
 		 1066 aa  43.5  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  31.54 
 
 		 1022 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.61 
 
 		 546 aa  43.5  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>